203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5990 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  67.71 
 
 		 1282 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  100 
 
 		 1281 aa  2523    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.9 
 
 		 1049 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  42.41 
 
 		 950 aa  452  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  41.27 
 
 		 1560 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  40.83 
 
 		 1092 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.61 
 
 		 957 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 1077 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  42.19 
 
 		 950 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 1119 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  35.13 
 
 		 1051 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  40.25 
 
 		 879 aa  367  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  37.62 
 
 		 974 aa  363  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 1007 aa  363  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.84 
 
 		 996 aa  350  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  37.16 
 
 		 1004 aa  349  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.62 
 
 		 1023 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 1268 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.82 
 
 		 1031 aa  338  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  36.34 
 
 		 1060 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 1182 aa  328  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  35.89 
 
 		 1022 aa  321  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  35.01 
 
 		 1148 aa  313  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  33.5 
 
 		 1164 aa  313  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.77 
 
 		 807 aa  290  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.27 
 
 		 697 aa  287  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.53 
 
 		 1026 aa  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  45.54 
 
 		 797 aa  281  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  34.92 
 
 		 905 aa  280  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  33.38 
 
 		 821 aa  278  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  39.3 
 
 		 836 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.81 
 
 		 817 aa  277  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.11 
 
 		 854 aa  271  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  30.66 
 
 		 1402 aa  268  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.71 
 
 		 683 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  45.16 
 
 		 854 aa  264  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  31.98 
 
 		 841 aa  263  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  35.1 
 
 		 817 aa  262  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  32.29 
 
 		 1047 aa  261  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.38 
 
 		 991 aa  261  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  46.79 
 
 		 769 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 860 aa  258  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.7 
 
 		 801 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 1435 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.07 
 
 		 669 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  31.53 
 
 		 832 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  32.19 
 
 		 637 aa  247  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  33.77 
 
 		 735 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  42.02 
 
 		 818 aa  238  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  30.95 
 
 		 876 aa  236  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.82 
 
 		 843 aa  235  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  45 
 
 		 829 aa  234  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  31.78 
 
 		 1000 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.03 
 
 		 839 aa  233  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  45.16 
 
 		 965 aa  233  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32.01 
 
 		 795 aa  232  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  31.73 
 
 		 794 aa  231  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.86 
 
 		 895 aa  229  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  43.26 
 
 		 763 aa  227  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1034 aa  226  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  32.88 
 
 		 863 aa  226  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  31.33 
 
 		 814 aa  224  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  29.5 
 
 		 1310 aa  222  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 803 aa  221  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  42.5 
 
 		 1152 aa  218  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  41.79 
 
 		 769 aa  214  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  28.89 
 
 		 764 aa  212  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.13 
 
 		 798 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.85 
 
 		 670 aa  199  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  41.38 
 
 		 687 aa  197  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.3 
 
 		 839 aa  194  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  39.64 
 
 		 799 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.05 
 
 		 733 aa  191  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  34.22 
 
 		 1076 aa  183  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  36.25 
 
 		 805 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  39.73 
 
 		 832 aa  172  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  36.88 
 
 		 575 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.07 
 
 		 769 aa  161  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  38.17 
 
 		 436 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  34.53 
 
 		 516 aa  145  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 412 aa  134  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  39.25 
 
 		 484 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.53 
 
 		 630 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  32.79 
 
 		 524 aa  123  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  29.91 
 
 		 600 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.59 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.07 
 
 		 485 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 453 aa  108  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  33.85 
 
 		 539 aa  95.9  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  28.42 
 
 		 458 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  45.35 
 
 		 973 aa  65.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  42.68 
 
 		 765 aa  62.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 592 aa  61.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  30.81 
 
 		 465 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1171 aa  58.9  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>