123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1145 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  100 
 
 
670 aa  1317    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  37.3 
 
 
836 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  39.37 
 
 
697 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  43.15 
 
 
807 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  36.48 
 
 
905 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  50.45 
 
 
769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  40.47 
 
 
854 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  44.52 
 
 
769 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.05 
 
 
735 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
1132 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  51.63 
 
 
854 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
1007 aa  210  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  39.32 
 
 
669 aa  210  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  51.42 
 
 
818 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  43.71 
 
 
801 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  34.3 
 
 
821 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  43.8 
 
 
683 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  41.2 
 
 
965 aa  204  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
1282 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  43.15 
 
 
484 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  38.52 
 
 
797 aa  201  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  47.09 
 
 
763 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  50 
 
 
1560 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  47.98 
 
 
1092 aa  200  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  50.23 
 
 
1077 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  46.85 
 
 
1281 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.54 
 
 
829 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  39.38 
 
 
841 aa  197  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 
1119 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.79 
 
 
996 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  41.84 
 
 
839 aa  194  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.24 
 
 
637 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.99 
 
 
991 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  45.95 
 
 
817 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.9 
 
 
1051 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  33.86 
 
 
805 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  36.02 
 
 
843 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  45.58 
 
 
687 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.02 
 
 
957 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  43.52 
 
 
973 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  45 
 
 
769 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
1182 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  43.51 
 
 
950 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
1268 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.35 
 
 
1060 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  42.86 
 
 
795 aa  178  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  45.1 
 
 
1148 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  46.77 
 
 
1164 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  37.5 
 
 
974 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.67 
 
 
1049 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  39.7 
 
 
1022 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  41.14 
 
 
1031 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  37.3 
 
 
1023 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  40.68 
 
 
1026 aa  170  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  42.59 
 
 
950 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  42.59 
 
 
1004 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  40.64 
 
 
1310 aa  156  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  40.47 
 
 
516 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.21 
 
 
879 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  38.78 
 
 
1402 aa  155  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
1034 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
1435 aa  153  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  38.25 
 
 
1047 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  40.57 
 
 
1152 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.28 
 
 
817 aa  146  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  34.47 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  33.02 
 
 
832 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  32.38 
 
 
895 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
860 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  40.72 
 
 
863 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
851 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
851 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
851 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  39.37 
 
 
1000 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  34.07 
 
 
832 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.94 
 
 
799 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.74 
 
 
876 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  43.56 
 
 
733 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
803 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  32.12 
 
 
1076 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
412 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  36.02 
 
 
630 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.52 
 
 
839 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  35.59 
 
 
764 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  36.76 
 
 
465 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.56 
 
 
798 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.5 
 
 
814 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.4 
 
 
524 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  34.29 
 
 
600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  34.91 
 
 
575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
453 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.39 
 
 
539 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  36.6 
 
 
485 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.65 
 
 
794 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.03 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.86 
 
 
2449 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.51 
 
 
3409 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  25.82 
 
 
414 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
406 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
613 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>