More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1514 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  100 
 
 		 895 aa  1773    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.68 
 
 		 950 aa  255  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  31.4 
 
 		 1092 aa  254  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1268 aa  254  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.6 
 
 		 957 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.53 
 
 		 1031 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 1132 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  31.1 
 
 		 1148 aa  239  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  30.56 
 
 		 1281 aa  238  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.23 
 
 		 1049 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  29.46 
 
 		 973 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  31.92 
 
 		 1004 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1051 aa  234  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.63 
 
 		 1022 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 1282 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  31.51 
 
 		 1047 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 1119 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  30.19 
 
 		 1560 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1164 aa  230  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1007 aa  228  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.01 
 
 		 879 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  31.93 
 
 		 950 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.69 
 
 		 996 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 1182 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  30.75 
 
 		 905 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  29.57 
 
 		 821 aa  213  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 1077 aa  211  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.81 
 
 		 832 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  39.76 
 
 		 763 aa  208  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  31.46 
 
 		 974 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  35.48 
 
 		 1026 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.48 
 
 		 683 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  32.18 
 
 		 769 aa  204  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  36.61 
 
 		 1060 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  35.43 
 
 		 1152 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.45 
 
 		 817 aa  200  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.38 
 
 		 797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  30.32 
 
 		 836 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  37.36 
 
 		 807 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  30.76 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  29.69 
 
 		 1023 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 860 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  31.36 
 
 		 735 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  32.34 
 
 		 801 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.25 
 
 		 854 aa  190  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.93 
 
 		 669 aa  189  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  29.7 
 
 		 794 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.68 
 
 		 991 aa  185  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  40.96 
 
 		 854 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  31.26 
 
 		 841 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  37.03 
 
 		 829 aa  180  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  36.06 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 1435 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  31.56 
 
 		 1000 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  35.14 
 
 		 1402 aa  177  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32.54 
 
 		 697 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.22 
 
 		 1310 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 803 aa  175  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 1034 aa  175  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  33.57 
 
 		 839 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.04 
 
 		 687 aa  171  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.5 
 
 		 965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  33.42 
 
 		 817 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  31.64 
 
 		 818 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  35.59 
 
 		 876 aa  163  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  35.87 
 
 		 814 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  30.75 
 
 		 764 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  31.13 
 
 		 769 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  34.97 
 
 		 805 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  26.95 
 
 		 798 aa  155  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.77 
 
 		 843 aa  151  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  40.39 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  27.66 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  33.69 
 
 		 799 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.03 
 
 		 1076 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32.71 
 
 		 795 aa  141  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.74 
 
 		 670 aa  138  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.1 
 
 		 769 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  35.98 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  36.41 
 
 		 575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.14 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  35.91 
 
 		 484 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  27.31 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.51 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 453 aa  80.1  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  33.15 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  27.76 
 
 		 630 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  29.27 
 
 		 524 aa  77.4  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 591 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  33.15 
 
 		 600 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 		 539 aa  74.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  29.75 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>