154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1060 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 484 aa  946    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  43.15 
 
 		 670 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  48.28 
 
 		 769 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 1132 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 1007 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  43.87 
 
 		 637 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  35.33 
 
 		 836 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  44.39 
 
 		 854 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  37.74 
 
 		 769 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  41.78 
 
 		 905 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  41.4 
 
 		 1026 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  43.06 
 
 		 807 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  35.4 
 
 		 735 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  40.87 
 
 		 763 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  42.92 
 
 		 854 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  40.37 
 
 		 669 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  42.86 
 
 		 818 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  34.66 
 
 		 965 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  44.64 
 
 		 769 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  31.18 
 
 		 821 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  38.55 
 
 		 817 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  39.19 
 
 		 801 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  39.91 
 
 		 697 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  40.53 
 
 		 1092 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  41.04 
 
 		 839 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  39.72 
 
 		 797 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  41.01 
 
 		 683 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  40.81 
 
 		 1060 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  39.82 
 
 		 841 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  39.39 
 
 		 805 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  39.29 
 
 		 1560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  35.53 
 
 		 829 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 1182 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  38.1 
 
 		 795 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  39.25 
 
 		 1281 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 1282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.71 
 
 		 996 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.22 
 
 		 991 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 1268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  40.47 
 
 		 687 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 1077 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  39.37 
 
 		 1004 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  40 
 
 		 843 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1034 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 1119 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  36.73 
 
 		 974 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.89 
 
 		 973 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  37.21 
 
 		 950 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.97 
 
 		 1051 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.25 
 
 		 1023 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.74 
 
 		 957 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 851 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 851 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 851 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  36.99 
 
 		 1164 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 860 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  34.67 
 
 		 950 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  36.82 
 
 		 1022 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.91 
 
 		 895 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.78 
 
 		 1049 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.04 
 
 		 879 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.41 
 
 		 1031 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  37.5 
 
 		 1152 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.15 
 
 		 876 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 1435 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  43.42 
 
 		 733 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  35.35 
 
 		 1047 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  34.86 
 
 		 1148 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  32.3 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  36.15 
 
 		 817 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.44 
 
 		 1310 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 412 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  38.82 
 
 		 1402 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  33.19 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  35.65 
 
 		 764 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.6 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.04 
 
 		 539 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  34.27 
 
 		 832 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  31.31 
 
 		 832 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  35.94 
 
 		 863 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 803 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.76 
 
 		 798 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  29.39 
 
 		 839 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  27.99 
 
 		 794 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  31.58 
 
 		 1076 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 453 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  31.16 
 
 		 799 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  32.39 
 
 		 1000 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  32.98 
 
 		 485 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  28.82 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  30.42 
 
 		 575 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  30.29 
 
 		 630 aa  83.2  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  31.78 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  30.36 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  32.81 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 613 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  29.41 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 613 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>