More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0760 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  79.81 
 
 		 1164 aa  1655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  100 
 
 		 1148 aa  2273    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  43.75 
 
 		 1031 aa  476  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  41.27 
 
 		 1022 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  39.93 
 
 		 1047 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1051 aa  363  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  37.94 
 
 		 1092 aa  352  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 1077 aa  350  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  37.03 
 
 		 950 aa  347  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  31.48 
 
 		 832 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.16 
 
 		 973 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  37.32 
 
 		 974 aa  324  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1282 aa  323  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  34.9 
 
 		 1000 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36 
 
 		 1281 aa  320  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 1007 aa  319  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  37.15 
 
 		 1560 aa  314  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.17 
 
 		 1049 aa  314  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  36.17 
 
 		 863 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.66 
 
 		 879 aa  310  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 1132 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.84 
 
 		 957 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  37.65 
 
 		 950 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  33.42 
 
 		 839 aa  300  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.8 
 
 		 794 aa  300  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  35.36 
 
 		 1060 aa  298  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  31.94 
 
 		 1023 aa  296  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.93 
 
 		 798 aa  290  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  34.55 
 
 		 764 aa  288  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.47 
 
 		 814 aa  282  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 1268 aa  281  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  34.4 
 
 		 1004 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  30.54 
 
 		 905 aa  264  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  31.48 
 
 		 817 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  32.64 
 
 		 1026 aa  247  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  33.83 
 
 		 769 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  30.02 
 
 		 683 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 1435 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  32.02 
 
 		 1152 aa  235  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.95 
 
 		 841 aa  234  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  31.71 
 
 		 1402 aa  233  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  31.1 
 
 		 895 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  34.27 
 
 		 807 aa  231  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  31.57 
 
 		 669 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.81 
 
 		 843 aa  231  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  33.5 
 
 		 697 aa  230  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  40.62 
 
 		 797 aa  230  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  29.9 
 
 		 836 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.72 
 
 		 801 aa  224  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.04 
 
 		 991 aa  224  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.01 
 
 		 795 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 860 aa  221  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  30.02 
 
 		 839 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  42.46 
 
 		 1310 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1034 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  33.45 
 
 		 818 aa  214  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  39.19 
 
 		 854 aa  214  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  38.25 
 
 		 637 aa  212  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  30.09 
 
 		 854 aa  212  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  30.03 
 
 		 821 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  40.44 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  40.66 
 
 		 829 aa  205  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 803 aa  204  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.44 
 
 		 735 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.44 
 
 		 817 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  38.72 
 
 		 876 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  40.05 
 
 		 769 aa  192  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.3 
 
 		 965 aa  191  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  38.34 
 
 		 805 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  38.81 
 
 		 687 aa  189  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  45.1 
 
 		 670 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  41.67 
 
 		 575 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  44.65 
 
 		 832 aa  171  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  37.01 
 
 		 1076 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.67 
 
 		 733 aa  161  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.62 
 
 		 799 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  38.63 
 
 		 769 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.5 
 
 		 436 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.86 
 
 		 516 aa  110  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  34.86 
 
 		 484 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  31.73 
 
 		 630 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.12 
 
 		 465 aa  96.3  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.38 
 
 		 485 aa  87.4  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 453 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  28.31 
 
 		 600 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  30.24 
 
 		 524 aa  84  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.47 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  28.52 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  22.43 
 
 		 661 aa  69.3  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1119 aa  68.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  25.15 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 656 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.68 
 
 		 668 aa  64.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>