285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4266 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  82.6 
 
 		 1022 aa  1360    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  100 
 
 		 1031 aa  2016    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  43.52 
 
 		 1164 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  40.33 
 
 		 1148 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  38.64 
 
 		 1047 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.65 
 
 		 974 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  34.1 
 
 		 950 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.85 
 
 		 1051 aa  342  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.47 
 
 		 1281 aa  333  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.54 
 
 		 832 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.52 
 
 		 973 aa  330  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  36.57 
 
 		 1092 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1077 aa  327  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1119 aa  327  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 1282 aa  320  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.1 
 
 		 794 aa  317  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  33.17 
 
 		 1000 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.21 
 
 		 957 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1132 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  37.29 
 
 		 1560 aa  305  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 1007 aa  304  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  33.13 
 
 		 814 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  36.66 
 
 		 950 aa  291  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  36.25 
 
 		 1060 aa  289  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  35.09 
 
 		 1004 aa  288  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.43 
 
 		 863 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 1182 aa  269  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1268 aa  268  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  34.93 
 
 		 839 aa  263  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  33.23 
 
 		 1023 aa  263  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  33.49 
 
 		 798 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  33.33 
 
 		 879 aa  248  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  30.76 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  32.66 
 
 		 905 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  42.4 
 
 		 1402 aa  241  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.18 
 
 		 764 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  32.42 
 
 		 836 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  34.42 
 
 		 843 aa  234  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  30.78 
 
 		 821 aa  233  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.87 
 
 		 841 aa  232  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  31.81 
 
 		 683 aa  232  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  42.24 
 
 		 1310 aa  231  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  33.69 
 
 		 769 aa  230  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.38 
 
 		 895 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.69 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.68 
 
 		 817 aa  221  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  42.77 
 
 		 829 aa  218  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  32.2 
 
 		 876 aa  217  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  33.06 
 
 		 797 aa  217  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.34 
 
 		 839 aa  215  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32 
 
 		 697 aa  214  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 1435 aa  212  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  30.68 
 
 		 669 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  30.56 
 
 		 1026 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 860 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  41.79 
 
 		 854 aa  208  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  42.7 
 
 		 763 aa  207  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.48 
 
 		 991 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  31.74 
 
 		 637 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  29.51 
 
 		 854 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  30.56 
 
 		 795 aa  202  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  44.15 
 
 		 801 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  40.6 
 
 		 818 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 803 aa  201  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  40.19 
 
 		 1152 aa  198  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 1034 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 851 aa  188  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 851 aa  188  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 851 aa  188  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  35.13 
 
 		 735 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.73 
 
 		 687 aa  183  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  40.49 
 
 		 769 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  37.61 
 
 		 805 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  47.11 
 
 		 575 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  28.93 
 
 		 1076 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.23 
 
 		 670 aa  166  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  32.34 
 
 		 799 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  38.82 
 
 		 733 aa  159  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.26 
 
 		 832 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.02 
 
 		 769 aa  136  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35.95 
 
 		 436 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  30.29 
 
 		 516 aa  109  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  36.94 
 
 		 484 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.03 
 
 		 524 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.02 
 
 		 630 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 412 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.53 
 
 		 485 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.04 
 
 		 465 aa  90.1  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  29.41 
 
 		 600 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 453 aa  89  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.23 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.04 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.13 
 
 		 1049 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  28.24 
 
 		 600 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  35.37 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  22.71 
 
 		 438 aa  62  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  44.74 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  27.8 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 662 aa  56.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>