127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0278 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  48.69 
 
 		 836 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 854 aa  1711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.6 
 
 		 839 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  35.71 
 
 		 818 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.06 
 
 		 991 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  37.97 
 
 		 829 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  39.97 
 
 		 763 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.12 
 
 		 965 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.21 
 
 		 905 aa  350  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  33.7 
 
 		 769 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.17 
 
 		 821 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.44 
 
 		 669 aa  331  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  31.43 
 
 		 801 aa  324  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  31.42 
 
 		 817 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 1132 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.91 
 
 		 697 aa  320  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.77 
 
 		 841 aa  320  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  33.89 
 
 		 795 aa  317  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.37 
 
 		 683 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  36.14 
 
 		 807 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  31.72 
 
 		 854 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.28 
 
 		 687 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  35.07 
 
 		 843 aa  303  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  33.54 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 		 1007 aa  291  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 805 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  39.32 
 
 		 797 aa  287  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  33.51 
 
 		 735 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  33.9 
 
 		 1560 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 769 aa  269  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  45.16 
 
 		 1281 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 1282 aa  261  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  41.46 
 
 		 950 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1119 aa  250  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 1268 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  43.17 
 
 		 973 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.05 
 
 		 1049 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 1077 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  46.84 
 
 		 1004 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.93 
 
 		 957 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  42.11 
 
 		 1026 aa  241  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.42 
 
 		 1051 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  40.64 
 
 		 996 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.44 
 
 		 1023 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  43.83 
 
 		 1060 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  44.52 
 
 		 950 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 1182 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  40.12 
 
 		 1092 aa  221  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  31.38 
 
 		 1164 aa  220  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.05 
 
 		 670 aa  220  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  44.1 
 
 		 1022 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.93 
 
 		 1148 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  41.79 
 
 		 1031 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  29.97 
 
 		 879 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.46 
 
 		 817 aa  207  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  34.18 
 
 		 1047 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  36.8 
 
 		 1152 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 1435 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  37.83 
 
 		 1402 aa  187  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  44.75 
 
 		 863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  38.56 
 
 		 1310 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  37.1 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1034 aa  180  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 860 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.83 
 
 		 1000 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.25 
 
 		 895 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  36.28 
 
 		 832 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  32.28 
 
 		 794 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  35.09 
 
 		 839 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  40.64 
 
 		 436 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  33.43 
 
 		 798 aa  161  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.15 
 
 		 769 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  34.31 
 
 		 876 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  38.65 
 
 		 1076 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 803 aa  158  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  44.39 
 
 		 484 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.95 
 
 		 799 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  35.86 
 
 		 733 aa  153  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  31.47 
 
 		 814 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  36.2 
 
 		 832 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  40.98 
 
 		 465 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.1 
 
 		 764 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 453 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.91 
 
 		 630 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  30.9 
 
 		 600 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  37.5 
 
 		 575 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 458 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  36.26 
 
 		 539 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.58 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  24.38 
 
 		 412 aa  51.2  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 465 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  25.85 
 
 		 612 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  29.56 
 
 		 485 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>