273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0644 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  68.46 
 
 		 1281 aa  875    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1282 aa  2515    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  41.01 
 
 		 1560 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  39.43 
 
 		 950 aa  429  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.12 
 
 		 1049 aa  430  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  39.67 
 
 		 1092 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 1077 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.67 
 
 		 957 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 1119 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.63 
 
 		 973 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  39.63 
 
 		 950 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  38.81 
 
 		 879 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1132 aa  365  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1007 aa  363  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.22 
 
 		 1051 aa  362  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.5 
 
 		 1004 aa  356  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.89 
 
 		 1060 aa  350  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  38.38 
 
 		 974 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.51 
 
 		 1031 aa  344  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 1268 aa  341  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.78 
 
 		 1023 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.24 
 
 		 996 aa  339  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.57 
 
 		 1148 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  35.99 
 
 		 1022 aa  328  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1182 aa  324  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  35.72 
 
 		 1164 aa  320  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  33.29 
 
 		 807 aa  311  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.91 
 
 		 905 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.25 
 
 		 801 aa  285  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.53 
 
 		 836 aa  284  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.86 
 
 		 854 aa  280  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.87 
 
 		 821 aa  280  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 817 aa  278  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  44.89 
 
 		 797 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  33.69 
 
 		 1026 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  33.74 
 
 		 841 aa  268  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.02 
 
 		 697 aa  267  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  46.65 
 
 		 854 aa  263  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  46.56 
 
 		 769 aa  263  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.59 
 
 		 669 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.84 
 
 		 991 aa  260  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 860 aa  259  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.21 
 
 		 817 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  40.5 
 
 		 1047 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.15 
 
 		 683 aa  254  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1435 aa  249  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  32.77 
 
 		 637 aa  249  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.82 
 
 		 832 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  31.64 
 
 		 818 aa  247  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  31.27 
 
 		 735 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.53 
 
 		 839 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  30.79 
 
 		 895 aa  240  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  29.29 
 
 		 965 aa  239  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  33.08 
 
 		 843 aa  238  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  45.06 
 
 		 829 aa  235  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  43.89 
 
 		 763 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  29.46 
 
 		 1310 aa  232  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  37.67 
 
 		 769 aa  232  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 851 aa  232  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  30.59 
 
 		 795 aa  230  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 1034 aa  229  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  42.82 
 
 		 876 aa  228  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 803 aa  226  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  29.92 
 
 		 1152 aa  226  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  43.96 
 
 		 794 aa  224  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  29.89 
 
 		 1000 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  31.55 
 
 		 764 aa  219  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  33.17 
 
 		 687 aa  211  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  31 
 
 		 863 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  47.3 
 
 		 670 aa  202  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.11 
 
 		 814 aa  195  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  27.99 
 
 		 805 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  41.72 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  38.48 
 
 		 799 aa  190  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.71 
 
 		 839 aa  189  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  35.18 
 
 		 1076 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  40.48 
 
 		 798 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  40.64 
 
 		 832 aa  176  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.61 
 
 		 516 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  38.55 
 
 		 436 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.07 
 
 		 769 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  38.99 
 
 		 575 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 412 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.18 
 
 		 630 aa  131  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  38.32 
 
 		 484 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  32.75 
 
 		 600 aa  128  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  34.41 
 
 		 524 aa  128  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  30.14 
 
 		 465 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  34.54 
 
 		 485 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 453 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  34.36 
 
 		 539 aa  99.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  27.74 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  28.71 
 
 		 465 aa  67  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  35.1 
 
 		 425 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 543 aa  61.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  42.5 
 
 		 765 aa  61.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1171 aa  61.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>