196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2278 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  60.09 
 
 		 1004 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1268 aa  2425    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  41.04 
 
 		 950 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.5 
 
 		 1049 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  39.29 
 
 		 973 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38.07 
 
 		 1092 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  37 
 
 		 957 aa  360  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  39.56 
 
 		 950 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  35.43 
 
 		 1560 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.85 
 
 		 1281 aa  345  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.83 
 
 		 1060 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1119 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.57 
 
 		 879 aa  337  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 1132 aa  336  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 1282 aa  330  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 1007 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.4 
 
 		 996 aa  329  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  35.94 
 
 		 1051 aa  325  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  35.53 
 
 		 974 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 1077 aa  310  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.12 
 
 		 1023 aa  291  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  34.29 
 
 		 1164 aa  290  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.54 
 
 		 817 aa  287  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  32.71 
 
 		 1031 aa  278  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  33.79 
 
 		 1148 aa  278  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 1182 aa  273  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.28 
 
 		 1022 aa  267  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.78 
 
 		 821 aa  266  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  31.68 
 
 		 832 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  30.39 
 
 		 1047 aa  261  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 854 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 860 aa  251  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  43.14 
 
 		 817 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  35.43 
 
 		 1026 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  36.4 
 
 		 836 aa  249  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  31.39 
 
 		 905 aa  248  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  32.3 
 
 		 1402 aa  248  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 1435 aa  247  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  43.97 
 
 		 769 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  36.84 
 
 		 991 aa  245  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 1034 aa  244  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.61 
 
 		 801 aa  244  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  32.87 
 
 		 841 aa  244  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  40 
 
 		 895 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  32.09 
 
 		 1310 aa  240  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.89 
 
 		 807 aa  239  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  31.76 
 
 		 839 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 851 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 851 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 851 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  43.29 
 
 		 669 aa  236  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  42.66 
 
 		 637 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  42.86 
 
 		 797 aa  235  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.75 
 
 		 795 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  45.94 
 
 		 763 aa  232  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  40.56 
 
 		 1152 aa  231  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  43.75 
 
 		 683 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  29.78 
 
 		 854 aa  228  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 803 aa  227  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.43 
 
 		 863 aa  225  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.96 
 
 		 829 aa  224  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  30.26 
 
 		 1000 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  33.28 
 
 		 818 aa  221  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  42.22 
 
 		 876 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.02 
 
 		 697 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  40.15 
 
 		 769 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.95 
 
 		 843 aa  213  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  30.63 
 
 		 965 aa  211  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40 
 
 		 735 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  29.74 
 
 		 814 aa  204  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.8 
 
 		 794 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.52 
 
 		 733 aa  197  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  36.66 
 
 		 798 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  29.55 
 
 		 805 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  27.44 
 
 		 1076 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.01 
 
 		 687 aa  191  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.73 
 
 		 799 aa  186  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  37.76 
 
 		 764 aa  181  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  36.87 
 
 		 670 aa  181  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  29.54 
 
 		 839 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.33 
 
 		 832 aa  156  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  34.78 
 
 		 575 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.33 
 
 		 769 aa  138  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  40.74 
 
 		 484 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  34.4 
 
 		 436 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  34.4 
 
 		 516 aa  119  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.38 
 
 		 630 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  27.08 
 
 		 600 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 412 aa  95.9  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.16 
 
 		 539 aa  94  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  32.26 
 
 		 485 aa  93.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.43 
 
 		 524 aa  93.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  31.69 
 
 		 465 aa  92.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 453 aa  90.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.92 
 
 		 458 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.48 
 
 		 652 aa  80.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  26.72 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.32 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>