140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0363 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 769 aa  1499    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.01 
 
 		 670 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1132 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 1007 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  47.44 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  39.62 
 
 		 836 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  33.7 
 
 		 905 aa  185  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  43.5 
 
 		 1560 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  44.19 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  38.95 
 
 		 854 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.63 
 
 		 991 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  38.78 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  40.38 
 
 		 797 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  42.86 
 
 		 1092 aa  173  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  41.07 
 
 		 1281 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  46.19 
 
 		 829 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  37.59 
 
 		 854 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1282 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  41.59 
 
 		 817 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  42.33 
 
 		 687 aa  167  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  38.4 
 
 		 805 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  41.7 
 
 		 669 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  32.85 
 
 		 683 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  40.18 
 
 		 950 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  40.65 
 
 		 965 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  43.26 
 
 		 769 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  39.2 
 
 		 818 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  37.23 
 
 		 1026 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  41.96 
 
 		 697 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  38.39 
 
 		 973 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 1077 aa  161  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  39.3 
 
 		 795 aa  160  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  37.45 
 
 		 841 aa  160  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  43.24 
 
 		 996 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.74 
 
 		 1051 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.05 
 
 		 957 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.5 
 
 		 1049 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  38.67 
 
 		 974 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  38.18 
 
 		 801 aa  154  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  42.01 
 
 		 1060 aa  154  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  38.36 
 
 		 821 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  32.68 
 
 		 637 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 1119 aa  150  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  35.09 
 
 		 950 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  41.2 
 
 		 769 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  31.61 
 
 		 843 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  39.19 
 
 		 1004 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  36.39 
 
 		 1148 aa  147  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  38.43 
 
 		 1031 aa  147  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 860 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 1268 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  35.79 
 
 		 839 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 851 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  37.99 
 
 		 1022 aa  143  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  36.67 
 
 		 895 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 1182 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  33.7 
 
 		 1310 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  38.22 
 
 		 1164 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  37.67 
 
 		 516 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  33.77 
 
 		 436 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  35.95 
 
 		 1047 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  34.16 
 
 		 1402 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  32.88 
 
 		 735 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  36.55 
 
 		 832 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1034 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  34.3 
 
 		 1152 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1435 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  41.36 
 
 		 876 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  35.29 
 
 		 1023 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.43 
 
 		 799 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  37.96 
 
 		 817 aa  125  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.78 
 
 		 465 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.93 
 
 		 879 aa  119  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 803 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  33.49 
 
 		 630 aa  118  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  37.67 
 
 		 832 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  36.2 
 
 		 733 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.11 
 
 		 575 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  33.64 
 
 		 1076 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 453 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 412 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  31.61 
 
 		 839 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.68 
 
 		 798 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  33.65 
 
 		 863 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  33.18 
 
 		 1000 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  35.71 
 
 		 764 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  32.7 
 
 		 600 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.18 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  35.35 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  33.33 
 
 		 794 aa  94.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  33.99 
 
 		 458 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.05 
 
 		 814 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  31.25 
 
 		 485 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  37.11 
 
 		 612 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 644 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 819 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  29.08 
 
 		 485 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 350 aa  48.9  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>