284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2050 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 
763 aa  1520    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  46.14 
 
 
829 aa  558  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  39.97 
 
 
854 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  35.57 
 
 
836 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  39.27 
 
 
965 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  37.78 
 
 
839 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  38.81 
 
 
818 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.72 
 
 
991 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  34.9 
 
 
821 aa  366  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.77 
 
 
687 aa  360  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  36.75 
 
 
769 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  38.63 
 
 
905 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  37.01 
 
 
841 aa  347  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  34.1 
 
 
697 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.04 
 
 
801 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  34.62 
 
 
807 aa  332  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  35.37 
 
 
817 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  36.68 
 
 
843 aa  324  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  36.39 
 
 
669 aa  323  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  34.49 
 
 
683 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  36.25 
 
 
854 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 
1132 aa  310  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  32.06 
 
 
795 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  33.46 
 
 
797 aa  307  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  33.11 
 
 
805 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  31.9 
 
 
735 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  34.72 
 
 
637 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  32.85 
 
 
769 aa  290  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
1007 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  49.83 
 
 
1560 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  45.65 
 
 
1026 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.18 
 
 
950 aa  263  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  41.63 
 
 
973 aa  254  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.61 
 
 
1004 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
1268 aa  248  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
1119 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
1077 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  38.41 
 
 
1092 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
1282 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.72 
 
 
1049 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.54 
 
 
1023 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  38.95 
 
 
1060 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.41 
 
 
957 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  43.26 
 
 
1281 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
1182 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  46.08 
 
 
1051 aa  234  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  44.48 
 
 
950 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  45.48 
 
 
974 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.72 
 
 
996 aa  229  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  33.18 
 
 
1310 aa  224  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.43 
 
 
1031 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  43.02 
 
 
1022 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  42.9 
 
 
1152 aa  219  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  38.46 
 
 
1148 aa  218  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  41.05 
 
 
1402 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  43.52 
 
 
1164 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  39.29 
 
 
670 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
1034 aa  204  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  39.76 
 
 
895 aa  204  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
860 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  36.89 
 
 
1047 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  34.09 
 
 
817 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
1435 aa  193  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  37.44 
 
 
876 aa  193  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
851 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
851 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
851 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
803 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  45.27 
 
 
769 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  32.84 
 
 
516 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  40.56 
 
 
1076 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  40.55 
 
 
799 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  26.37 
 
 
832 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  41.6 
 
 
863 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  35 
 
 
839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  37.88 
 
 
798 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  36.24 
 
 
1000 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.37 
 
 
733 aa  157  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  37.39 
 
 
436 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.33 
 
 
832 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.44 
 
 
794 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  27.06 
 
 
814 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  41.59 
 
 
484 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  31.35 
 
 
465 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
412 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.89 
 
 
764 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
453 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  39.81 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.06 
 
 
630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.56 
 
 
524 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.27 
 
 
458 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.53 
 
 
600 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.83 
 
 
539 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  30.04 
 
 
485 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
436 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4514  ATPase domain-containing protein  34.42 
 
 
485 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.29 
 
 
446 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
528 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  32.69 
 
 
485 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  28.95 
 
 
612 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>