More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3312 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  884    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  32.79 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 686 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  31.1 
 
 		 496 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.58 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.62 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 500 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  31.67 
 
 		 696 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  34.8 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32.08 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  29.75 
 
 		 356 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  34.11 
 
 		 689 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 564 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.3 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.34 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3764  histidine kinase  31.02 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 887 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 728 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  32.35 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 887 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0884  histidine kinase  33.46 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.456358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 902 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 708 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 892 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 1043 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 608 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.83 
 
 		 486 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 829 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 644 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 640 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  31.67 
 
 		 698 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 1013 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 816 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 608 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  25.63 
 
 		 608 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 905 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  34.33 
 
 		 496 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0834  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 439 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  30.33 
 
 		 529 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 551 aa  96.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 466 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  30.49 
 
 		 636 aa  96.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 633 aa  96.7  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 316 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  25.63 
 
 		 610 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 612 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 566 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 463 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  26.57 
 
 		 614 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  29.02 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  28.88 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 907 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  26.72 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 632 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.73 
 
 		 354 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1516 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 465 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 465 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 680 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 854 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.92 
 
 		 902 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 579 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5498  two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  30.88 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  28.21 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  30.74 
 
 		 885 aa  93.2  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 476 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 815 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 912 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  27.23 
 
 		 613 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 1178 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 894 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>