More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1335 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  941    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 466 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 486 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 476 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 487 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  34.32 
 
 		 486 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 465 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  35.05 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  34.85 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 502 aa  213  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  35.02 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  34.73 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  34.87 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  32.3 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  31.74 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 533 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  32.14 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 451 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 472 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  38.55 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  34.05 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  35.09 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 411 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 411 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 472 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  34.47 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.15 
 
 		 415 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  32.82 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  31.11 
 
 		 463 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  33.99 
 
 		 445 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  29.71 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.34 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.83 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  30.18 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  33.83 
 
 		 715 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 448 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>