More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7122 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
410 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  62.56 
 
 
403 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  62.31 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  59.7 
 
 
406 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  63.32 
 
 
407 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  63.32 
 
 
424 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  63.32 
 
 
424 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  57.54 
 
 
408 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  58.15 
 
 
409 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  52.25 
 
 
406 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  52.25 
 
 
406 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  52.91 
 
 
407 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  54.79 
 
 
312 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.58 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.58 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.58 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.58 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.66 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.66 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.66 
 
 
399 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.84 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.84 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.84 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.84 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.92 
 
 
412 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.42 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.42 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.42 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.42 
 
 
412 aa  166  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.91 
 
 
412 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.86 
 
 
430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  26.7 
 
 
414 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  26.7 
 
 
414 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  26.46 
 
 
414 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  27.52 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.33 
 
 
412 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.47 
 
 
500 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.9 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  32.2 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  32.2 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.38 
 
 
393 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  47.73 
 
 
220 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
399 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  31.36 
 
 
421 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.53 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  31.59 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  31.13 
 
 
398 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  23.54 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  23.54 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  30.88 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.11 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.11 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.11 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.11 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  30.88 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  30.88 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.12 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.12 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.12 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  30.88 
 
 
398 aa  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  25.07 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  25.07 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.06 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12046  transposase  35.43 
 
 
196 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.722440000000001e-24  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.92 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  30.67 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  30.67 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  30.67 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  30.67 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  30.67 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>