More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4216 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
407 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
424 aa  840    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
424 aa  840    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  67.58 
 
 
408 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  68 
 
 
409 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  62.94 
 
 
406 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  62.94 
 
 
406 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  63.32 
 
 
410 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  60.2 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  59.6 
 
 
403 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  59.35 
 
 
403 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  64.74 
 
 
407 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  64.9 
 
 
312 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.18 
 
 
399 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.18 
 
 
399 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.18 
 
 
399 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.18 
 
 
399 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.52 
 
 
399 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.52 
 
 
399 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.52 
 
 
399 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.2 
 
 
412 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.25 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.25 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.25 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.25 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.82 
 
 
412 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.82 
 
 
412 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.82 
 
 
412 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.07 
 
 
412 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.32 
 
 
412 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.36 
 
 
500 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
412 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  27.64 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  27.64 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.53 
 
 
430 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  27.39 
 
 
414 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.91 
 
 
397 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  26.82 
 
 
418 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.23 
 
 
403 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  31.31 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.23 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  31.07 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 
406 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  24.64 
 
 
406 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  24.64 
 
 
406 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.95 
 
 
407 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  27.43 
 
 
405 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.22 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  29.1 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  44.36 
 
 
220 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.09 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.09 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.09 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.74 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.74 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.74 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.74 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3979  hypothetical protein  75 
 
 
406 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.65 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  28.72 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12045  transposase  37.01 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3513499999999995e-21  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  28.64 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  28.72 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  28.72 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  28.46 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  28.72 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  28.72 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  28.46 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.38 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.38 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.38 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.13 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.13 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>