288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4175 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  66.5 
 
 
409 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  61.27 
 
 
408 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  62.94 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  62.94 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  62.94 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.73 
 
 
403 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.49 
 
 
403 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.6 
 
 
406 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  52.25 
 
 
410 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  57.18 
 
 
407 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  60.78 
 
 
312 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.05 
 
 
399 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.05 
 
 
399 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.05 
 
 
399 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.05 
 
 
399 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.63 
 
 
399 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.63 
 
 
399 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.63 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.4 
 
 
416 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.4 
 
 
416 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.4 
 
 
416 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.4 
 
 
416 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 
412 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 
412 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 
412 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 
412 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.51 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 
412 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.08 
 
 
412 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28 
 
 
412 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.3 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  25.96 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  25.96 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  25.72 
 
 
414 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  24.19 
 
 
418 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 
397 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.1 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.1 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.1 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.1 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.16 
 
 
403 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.16 
 
 
403 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.16 
 
 
403 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  29.88 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  29.63 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.13 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.5 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1615  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.88 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  23.1 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  23.1 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.67 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0549  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000582455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  29.46 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  27.7 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  29.46 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.02 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  29.21 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.02 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1666  transposase IS116/IS110/IS902  61.4 
 
 
100 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0424632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  28.96 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12046  transposase  34.43 
 
 
196 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.722440000000001e-24  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  29.85 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  29.85 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  30.86 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>