14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1666 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1666  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
100 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0424632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  61.4 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  61.4 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  57.97 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  57.97 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  57.97 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  64.44 
 
 
410 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  59.09 
 
 
408 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  56.36 
 
 
409 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  62 
 
 
403 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  62 
 
 
403 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3979  hypothetical protein  68.42 
 
 
406 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  52.83 
 
 
407 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  50 
 
 
406 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>