186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4852 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  82.97 
 
 		 414 aa  732    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  82.73 
 
 		 414 aa  728    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  82.97 
 
 		 414 aa  732    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  100 
 
 		 418 aa  874    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.37 
 
 		 412 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  51.59 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.33 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.33 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.33 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.58 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.72 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.72 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.72 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.72 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.71 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.3 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  26.58 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.52 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.46 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.42 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.21 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  25.63 
 
 		 407 aa  136  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  25.63 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  25.63 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.56 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  25.67 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.06 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  24.19 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  24.19 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  23.72 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12046  transposase  28.72 
 
 		 196 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.722440000000001e-24  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.27 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.87 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.87 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.87 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.87 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.65 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  24.68 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  22.89 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  22.64 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  24.35 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  21.55 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  22.64 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  22.52 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  22.52 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.64 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  24.02 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.07 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.14 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.78 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.78 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.78 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  24.75 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  24.5 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  25.06 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  24.5 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  24.5 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  24.5 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.42 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  23.05 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  24.25 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  22.94 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.72 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0274  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.03 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.919516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1627  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 		 53 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>