More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3846 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  99.5 
 
 
398 aa  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  99.75 
 
 
398 aa  793    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  99.5 
 
 
398 aa  790    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  99.5 
 
 
398 aa  794    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  100 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  99.75 
 
 
398 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  99.5 
 
 
398 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  99.75 
 
 
398 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  99.75 
 
 
398 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  82.32 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  82.32 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  82.32 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  82.32 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  82.32 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  82.49 
 
 
420 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.49 
 
 
420 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.4 
 
 
420 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.09 
 
 
401 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  79.9 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  80.15 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  80.15 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  80.15 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.09 
 
 
401 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  80.59 
 
 
426 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  71.87 
 
 
421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  69.01 
 
 
408 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  68.75 
 
 
408 aa  511  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.17 
 
 
403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.21 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  77.78 
 
 
266 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  79.42 
 
 
245 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2705  putative IS110 transposase  77.43 
 
 
256 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 
401 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.76 
 
 
407 aa  203  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.43 
 
 
403 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.14 
 
 
404 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.43 
 
 
403 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.14 
 
 
404 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.14 
 
 
404 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.14 
 
 
404 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.43 
 
 
403 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.45 
 
 
397 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0274  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.919516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.759497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.88 
 
 
111 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5264  transposase IS116/IS110/IS902  81.98 
 
 
111 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.64 
 
 
412 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
393 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  25.94 
 
 
411 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  25.62 
 
 
411 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.8 
 
 
399 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.94 
 
 
412 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
399 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
399 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 
399 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.44 
 
 
411 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.3 
 
 
399 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.3 
 
 
399 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.62 
 
 
411 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.33 
 
 
412 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  29.37 
 
 
403 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.05 
 
 
399 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.13 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  26.5 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  26.5 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  29.11 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.78 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.78 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.78 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.36 
 
 
412 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>