258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4652 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
500 aa  1000    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  63.56 
 
 
416 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  63.56 
 
 
416 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  63.56 
 
 
416 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  63.56 
 
 
416 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.09 
 
 
412 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.09 
 
 
412 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.09 
 
 
412 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  42.82 
 
 
412 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  42.82 
 
 
412 aa  253  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  42.55 
 
 
412 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12045  transposase  63.16 
 
 
206 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3513499999999995e-21  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12046  transposase  67.76 
 
 
196 aa  194  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.722440000000001e-24  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  35.16 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  34.49 
 
 
407 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  34.49 
 
 
424 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  34.49 
 
 
424 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  34.51 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  34.51 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.15 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.92 
 
 
399 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.92 
 
 
399 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.92 
 
 
399 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.92 
 
 
399 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.86 
 
 
399 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.86 
 
 
399 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  29.86 
 
 
399 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.47 
 
 
410 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.7 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.53 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.24 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  28.42 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  27.55 
 
 
414 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  27.55 
 
 
414 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  27.27 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
412 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
517 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.68 
 
 
407 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.09 
 
 
312 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  58.97 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  58.97 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  58.97 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.06 
 
 
430 aa  99  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  61.04 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  61.04 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  61.04 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  61.04 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  61.04 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  51.95 
 
 
515 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  29.81 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.53 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.93 
 
 
402 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.93 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.23 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.54 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3468  hypothetical protein  64.29 
 
 
106 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  23.51 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  23.51 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  23.2 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.94 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.61 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.37 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  25.2 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  25.08 
 
 
418 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  22.57 
 
 
411 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  26.73 
 
 
394 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  25.16 
 
 
418 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.45 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2193  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1574  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0868  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0776051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0845  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2497  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164831  normal  0.0212022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  25.22 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.06 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  25.22 
 
 
425 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.06 
 
 
427 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.06 
 
 
427 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.06 
 
 
427 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>