59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1314 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.18 
 
 
403 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.18 
 
 
403 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  46.51 
 
 
406 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  47.73 
 
 
410 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  45.52 
 
 
409 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  46.62 
 
 
408 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  45.11 
 
 
424 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  45.11 
 
 
424 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  45.11 
 
 
407 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.57 
 
 
407 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2466  hypothetical protein  57.89 
 
 
85 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209351  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
500 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  38.17 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  38.17 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.93 
 
 
416 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.93 
 
 
416 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.93 
 
 
416 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.93 
 
 
416 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.58 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.57 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.89 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.89 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.86 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.89 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.89 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.43 
 
 
430 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  41.67 
 
 
408 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  41.67 
 
 
408 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 
406 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  31.07 
 
 
418 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12045  transposase  40 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3513499999999995e-21  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2807  transposase IS111A/IS1328/IS1533  54.76 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.04 
 
 
412 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  26.81 
 
 
414 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  26.81 
 
 
414 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  26.81 
 
 
414 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.25 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1653  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5408  normal  0.774587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.07 
 
 
399 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5290  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.959856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5050  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4599  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3502  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2134  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0526  ISPpu10, transposase  42.42 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.25 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.25 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.25 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.25 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.25 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.5 
 
 
421 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>