More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4599 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0526  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1653  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5408  normal  0.774587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2134  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3502  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4599  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5050  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5290  ISPpu10, transposase  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.959856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1430  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3254  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0923362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0590  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2671  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2583  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3331  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1421  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.8 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.23 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.39 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2997  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.77 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00357301  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.23 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.23 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5206  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.47 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0981183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.92 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.92 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  26.79 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.77 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.62 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.976951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.77 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4815  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0891  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.732659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0718  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000540983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2567  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0005  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.854592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1120  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4118  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1814  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0878  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0196  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4498  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0419  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3002  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4386  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1228  transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0655964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1035  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.709382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4039  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4419  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4700  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4179  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3109  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4472  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3457  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0198  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.410947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0243  invertase  28.66 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0856  invertase  28.66 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4544  invertase  28.66 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3698  invertase  28.66 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4477  IS621, transposase  28.62 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  26.04 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2733  IS621, transposase  28.93 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0780599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00714409  hitchhiker  0.00689732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2510  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5547  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4014  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.98 
 
 		 288 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.96 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1270  hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.251236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0422  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5427  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0687  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5245  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7776  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0271  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1833  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1618  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3615  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2773  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4428  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0327166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1663  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.75 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>