More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3615 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7776  transposase IS111A/IS1328/IS1533  99.69 
 
 
326 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5245  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4772  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1833  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2773  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0271  transposase IS111A/IS1328/IS1533  99.69 
 
 
326 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3615  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4428  transposase IS111A/IS1328/IS1533  99.69 
 
 
326 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0327166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0687  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1618  transposase IS111A/IS1328/IS1533  99.69 
 
 
326 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5427  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1663  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
326 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5343  transposase IS111A/IS1328/IS1533  94.24 
 
 
363 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.75 
 
 
325 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.06 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 
315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 
315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 
315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 
315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 
315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.87 
 
 
314 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.87 
 
 
314 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.55 
 
 
314 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.55 
 
 
314 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
315 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
315 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.81 
 
 
315 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.23 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.23 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.91 
 
 
309 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.91 
 
 
309 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
320 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.13 
 
 
318 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  33.01 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.19 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.08 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  41.42 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  41.42 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0479  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.58 
 
 
304 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4014  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5547  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2510  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775068  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  41.42 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.42 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.42 
 
 
312 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.42 
 
 
312 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  33.99 
 
 
323 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 
319 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
312 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
312 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
312 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
312 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  41.1 
 
 
315 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.69 
 
 
318 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.69 
 
 
318 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.87 
 
 
316 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.69 
 
 
318 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  41.1 
 
 
315 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.91 
 
 
320 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.91 
 
 
320 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  36.45 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  36.45 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.25 
 
 
320 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.25 
 
 
320 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.51 
 
 
316 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.91 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>