49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12045 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12045  transposase  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3513499999999995e-21  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.96 
 
 
416 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.96 
 
 
416 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.96 
 
 
416 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.96 
 
 
416 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  63.16 
 
 
500 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  45.41 
 
 
412 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  45.41 
 
 
412 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  45.41 
 
 
412 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  45.41 
 
 
412 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.88 
 
 
412 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.94 
 
 
412 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.3 
 
 
408 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
424 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  32.75 
 
 
407 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
424 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  32.37 
 
 
409 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  32.12 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  31.77 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  31.77 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.33 
 
 
399 aa  72  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.33 
 
 
399 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.33 
 
 
399 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.72 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.72 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.72 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.72 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  29.32 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  29.32 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  32.16 
 
 
410 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.91 
 
 
407 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  26.52 
 
 
414 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  26.52 
 
 
414 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  26.52 
 
 
414 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
406 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  40 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.96 
 
 
312 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  25 
 
 
430 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2807  transposase IS111A/IS1328/IS1533  39.19 
 
 
149 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  29.63 
 
 
416 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  29.63 
 
 
416 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.75 
 
 
397 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  24 
 
 
418 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.81 
 
 
412 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0034  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.07 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  33.96 
 
 
405 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.67 
 
 
319 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.67 
 
 
319 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.36 
 
 
321 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>