35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2807 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2807  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 		 149 aa  290  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  54.67 
 
 		 406 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  45.74 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  45.74 
 
 		 403 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  57.14 
 
 		 410 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  46.58 
 
 		 407 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  46.58 
 
 		 424 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  46.58 
 
 		 424 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  43.68 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  43.68 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  42.47 
 
 		 408 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  42.47 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.63 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  45.21 
 
 		 312 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  54.76 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40 
 
 		 500 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1197  transposase IS111A/IS1328/IS1533  41.1 
 
 		 416 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1634  transposase IS111A/IS1328/IS1533  41.1 
 
 		 416 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.320566  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3990  transposase IS111A/IS1328/IS1533  41.1 
 
 		 416 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.835338  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4764  transposase IS111A/IS1328/IS1533  41.1 
 
 		 416 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12045  transposase  39.19 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3513499999999995e-21  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.95 
 
 		 412 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.16 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  32.86 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  31.4 
 
 		 414 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  31.4 
 
 		 414 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  31.4 
 
 		 414 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.98 
 
 		 412 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  32.86 
 
 		 408 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>