20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2466 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1314  transposase IS111A/IS1328/IS1533  57.89 
 
 		 220 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  51.35 
 
 		 407 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  51.35 
 
 		 424 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  51.35 
 
 		 424 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  50.63 
 
 		 407 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  48.65 
 
 		 409 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1667  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  45.21 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0305373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  44.87 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  44.87 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  43.66 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  46.58 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  41.67 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  41.67 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  44.16 
 
 		 410 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  35.37 
 
 		 408 aa  41.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  35.37 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  28.57 
 
 		 414 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  28.57 
 
 		 414 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  28.57 
 
 		 414 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>