15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0820 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0820  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1437    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.931123  normal  0.0681477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0764  hypothetical protein  81.13 
 
 		 765 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.902908  normal  0.0151558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  49.12 
 
 		 499 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  40.7 
 
 		 1281 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  48.68 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 1282 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 1022 aa  50.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 1119 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 803 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  39.02 
 
 		 1031 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 876 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  51.11 
 
 		 974 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  40.96 
 
 		 1047 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>