More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7315 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1245 aa  2411    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  62.29 
 
 		 1065 aa  900    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 		 747 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  38.98 
 
 		 724 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  40.23 
 
 		 764 aa  360  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  38.67 
 
 		 719 aa  360  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  36.8 
 
 		 836 aa  357  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 		 725 aa  348  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.2 
 
 		 1129 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 806 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 806 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 806 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.72 
 
 		 859 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  34.8 
 
 		 978 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 778 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  34.4 
 
 		 808 aa  313  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 		 975 aa  310  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  35.14 
 
 		 1117 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.42 
 
 		 821 aa  309  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  34.61 
 
 		 825 aa  308  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 979 aa  308  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  35.45 
 
 		 822 aa  307  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  35.79 
 
 		 961 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.12 
 
 		 880 aa  302  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 819 aa  297  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.76 
 
 		 643 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 		 643 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.76 
 
 		 643 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 950 aa  296  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.53 
 
 		 890 aa  295  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  34.98 
 
 		 803 aa  293  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.08 
 
 		 727 aa  289  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.91 
 
 		 732 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.56 
 
 		 761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 		 714 aa  289  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  33.93 
 
 		 712 aa  288  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.67 
 
 		 814 aa  288  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.9 
 
 		 714 aa  288  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.86 
 
 		 734 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.92 
 
 		 735 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  35.14 
 
 		 752 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 		 727 aa  285  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 770 aa  283  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.35 
 
 		 720 aa  283  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 		 761 aa  283  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.72 
 
 		 728 aa  282  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 720 aa  282  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.15 
 
 		 618 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 769 aa  282  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 		 728 aa  281  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 764 aa  280  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 833 aa  280  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 776 aa  278  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.18 
 
 		 734 aa  278  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 		 779 aa  278  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 815 aa  277  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.25 
 
 		 640 aa  277  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 867 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  33.12 
 
 		 774 aa  276  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 830 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 750 aa  274  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 		 739 aa  274  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.54 
 
 		 775 aa  272  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.92 
 
 		 727 aa  270  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.73 
 
 		 712 aa  268  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35 
 
 		 625 aa  268  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.76 
 
 		 763 aa  268  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 730 aa  268  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 		 751 aa  266  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  33.92 
 
 		 757 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.23 
 
 		 784 aa  265  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 654 aa  264  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 		 817 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 661 aa  264  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  34.8 
 
 		 750 aa  263  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.89 
 
 		 776 aa  263  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.06 
 
 		 838 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.28 
 
 		 739 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 640 aa  261  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.54 
 
 		 755 aa  260  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 		 691 aa  260  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 723 aa  260  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.71 
 
 		 727 aa  259  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 		 741 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.3 
 
 		 648 aa  258  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 649 aa  258  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 668 aa  258  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.18 
 
 		 905 aa  258  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  34.67 
 
 		 723 aa  257  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 		 860 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 		 709 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  31.29 
 
 		 987 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  31.5 
 
 		 651 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.12 
 
 		 806 aa  254  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 765 aa  254  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 		 892 aa  254  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 662 aa  254  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>