More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1278 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  52.08 
 
 		 774 aa  723    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  100 
 
 		 727 aa  1499    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  43.3 
 
 		 836 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.61 
 
 		 764 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.04 
 
 		 859 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.13 
 
 		 890 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  40.23 
 
 		 825 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  37.36 
 
 		 808 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  39.02 
 
 		 803 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  36.96 
 
 		 764 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 		 695 aa  360  5e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  36.81 
 
 		 719 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 778 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.29 
 
 		 1129 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  34.39 
 
 		 724 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 747 aa  300  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  32.32 
 
 		 1117 aa  297  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  33.77 
 
 		 1306 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  29.61 
 
 		 978 aa  287  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 975 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 1245 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  31.6 
 
 		 822 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 979 aa  282  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.43 
 
 		 761 aa  280  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 725 aa  277  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 961 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 950 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 1065 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 806 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 806 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 806 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 815 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 867 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.54 
 
 		 814 aa  260  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.92 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  29.42 
 
 		 710 aa  257  5e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 769 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  30.82 
 
 		 838 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  30.97 
 
 		 821 aa  253  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.15 
 
 		 683 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.15 
 
 		 776 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  31.43 
 
 		 681 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.34 
 
 		 811 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.21 
 
 		 640 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.05 
 
 		 640 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 683 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 683 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 683 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.31 
 
 		 704 aa  247  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 683 aa  246  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.59 
 
 		 712 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 		 905 aa  246  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.81 
 
 		 739 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.06 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.58 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 		 648 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 683 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.21 
 
 		 727 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.21 
 
 		 727 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 683 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.24 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.24 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 833 aa  242  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.07 
 
 		 648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 683 aa  241  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  30.73 
 
 		 741 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  28.45 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.55 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 683 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 755 aa  239  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  30.36 
 
 		 714 aa  238  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  29.43 
 
 		 728 aa  238  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.17 
 
 		 775 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 713 aa  237  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 770 aa  236  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.42 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  29.39 
 
 		 752 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  28.04 
 
 		 643 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 		 714 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 654 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 830 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  29.36 
 
 		 734 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.93 
 
 		 806 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.85 
 
 		 735 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.36 
 
 		 728 aa  234  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 649 aa  233  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.08 
 
 		 824 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  28.41 
 
 		 723 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 730 aa  231  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 763 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.36 
 
 		 668 aa  229  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  28.78 
 
 		 732 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 		 817 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 662 aa  227  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 		 712 aa  227  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>