More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 814 aa  1666    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  44.69 
 
 		 838 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.15 
 
 		 950 aa  459  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  41.81 
 
 		 821 aa  435  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 815 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.4 
 
 		 725 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  42.71 
 
 		 830 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.73 
 
 		 769 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 		 695 aa  365  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.86 
 
 		 1129 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  35.84 
 
 		 719 aa  342  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  35.12 
 
 		 836 aa  326  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.99 
 
 		 890 aa  316  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  35.81 
 
 		 1117 aa  313  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.06 
 
 		 859 aa  312  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 		 764 aa  310  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 		 975 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 979 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 778 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 1245 aa  301  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  35.23 
 
 		 724 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  35.63 
 
 		 1306 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  36.95 
 
 		 764 aa  297  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.56 
 
 		 761 aa  297  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  32.75 
 
 		 978 aa  290  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 961 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  33.38 
 
 		 927 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 1065 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  34.32 
 
 		 825 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  33.49 
 
 		 822 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  31.98 
 
 		 808 aa  274  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  33.05 
 
 		 803 aa  273  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 747 aa  273  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.76 
 
 		 774 aa  263  8.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.84 
 
 		 643 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 		 643 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 		 643 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  30.48 
 
 		 727 aa  259  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  31.91 
 
 		 752 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.4 
 
 		 727 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.84 
 
 		 704 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.77 
 
 		 648 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 		 618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 		 761 aa  243  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.09 
 
 		 723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 		 727 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.56 
 
 		 776 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.53 
 
 		 640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.49 
 
 		 880 aa  234  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.78 
 
 		 750 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.88 
 
 		 905 aa  232  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.92 
 
 		 726 aa  232  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  32.32 
 
 		 711 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 867 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 		 751 aa  229  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 770 aa  229  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 649 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 654 aa  227  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  30.52 
 
 		 784 aa  226  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 763 aa  226  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 755 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 765 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.15 
 
 		 817 aa  226  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 730 aa  225  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.34 
 
 		 712 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.47 
 
 		 734 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  27.45 
 
 		 708 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 640 aa  221  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 720 aa  221  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  30.14 
 
 		 824 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.13 
 
 		 714 aa  220  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  29.98 
 
 		 824 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  29.69 
 
 		 732 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 819 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.27 
 
 		 683 aa  218  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.38 
 
 		 739 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.35 
 
 		 806 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  29.56 
 
 		 801 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.6 
 
 		 648 aa  213  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  29.84 
 
 		 789 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 678 aa  211  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.5 
 
 		 683 aa  211  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  30.35 
 
 		 655 aa  211  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  28.97 
 
 		 732 aa  211  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.45 
 
 		 722 aa  210  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.4 
 
 		 735 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 683 aa  210  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  28.67 
 
 		 638 aa  209  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  32.38 
 
 		 726 aa  210  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  31.45 
 
 		 654 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.89 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 658 aa  208  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 720 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.04 
 
 		 642 aa  207  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>