More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9363 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  100 
 
 
822 aa  1670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  51.64 
 
 
867 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  45.39 
 
 
724 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.53 
 
 
1129 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  45.47 
 
 
719 aa  482  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.7 
 
 
747 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  41.31 
 
 
1117 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  43.29 
 
 
1306 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  36.74 
 
 
978 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
695 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  38.12 
 
 
764 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  38.33 
 
 
961 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
764 aa  355  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
778 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  34.84 
 
 
836 aa  352  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.22 
 
 
890 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.51 
 
 
859 aa  333  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
1245 aa  330  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  32.72 
 
 
803 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
1065 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.43 
 
 
825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 
808 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.95 
 
 
774 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  33.03 
 
 
752 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
725 aa  287  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.44 
 
 
727 aa  278  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 
712 aa  276  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
806 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 
761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
806 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
806 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 
761 aa  272  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
979 aa  269  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.7 
 
 
814 aa  268  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.48 
 
 
776 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.66 
 
 
661 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.13 
 
 
755 aa  260  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
975 aa  260  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.44 
 
 
643 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  31.99 
 
 
987 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.57 
 
 
727 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 
643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 
643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
950 aa  254  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  31.55 
 
 
838 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 
824 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 
824 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.28 
 
 
648 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.37 
 
 
811 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
626 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.44 
 
 
765 aa  245  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.02 
 
 
821 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  30.88 
 
 
727 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.99 
 
 
704 aa  240  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 
769 aa  240  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 
662 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 
905 aa  237  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.97 
 
 
679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.11 
 
 
750 aa  234  6e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  30.74 
 
 
710 aa  234  7.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.87 
 
 
640 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.35 
 
 
649 aa  233  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
815 aa  232  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.6 
 
 
714 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  31.17 
 
 
667 aa  231  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.86 
 
 
739 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  31.24 
 
 
705 aa  230  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.69 
 
 
734 aa  230  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 
723 aa  230  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.4 
 
 
640 aa  230  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  30.06 
 
 
714 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.76 
 
 
693 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.94 
 
 
618 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
830 aa  227  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  34.81 
 
 
658 aa  227  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  29.55 
 
 
654 aa  226  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.79 
 
 
757 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.83 
 
 
704 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.4 
 
 
833 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  28.19 
 
 
625 aa  226  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  31.56 
 
 
665 aa  226  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 
751 aa  225  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.55 
 
 
681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 
709 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.9 
 
 
732 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 
795 aa  224  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.39 
 
 
734 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 
676 aa  223  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.06 
 
 
817 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.49 
 
 
658 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  30.18 
 
 
723 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  29.44 
 
 
656 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.14 
 
 
727 aa  221  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 
744 aa  221  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.46 
 
 
727 aa  221  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 
710 aa  220  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 
691 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 
724 aa  219  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.76 
 
 
701 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  31.65 
 
 
741 aa  219  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>