More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 890 aa  1776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  49.52 
 
 		 836 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.18 
 
 		 764 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  42.48 
 
 		 825 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  45.21 
 
 		 803 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  42.33 
 
 		 808 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.55 
 
 		 859 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  43.14 
 
 		 764 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 		 695 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  40.52 
 
 		 774 aa  428  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  37.96 
 
 		 727 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.4 
 
 		 1129 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  38.05 
 
 		 719 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  37.46 
 
 		 724 aa  360  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  37.32 
 
 		 1306 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  35.38 
 
 		 822 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  37.07 
 
 		 1117 aa  344  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 778 aa  335  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 1065 aa  330  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 806 aa  326  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 806 aa  326  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 806 aa  326  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 		 725 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 		 747 aa  312  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 961 aa  310  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  34.39 
 
 		 821 aa  309  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.04 
 
 		 814 aa  308  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 1245 aa  304  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  35.42 
 
 		 978 aa  302  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.55 
 
 		 761 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 979 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 		 975 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 815 aa  289  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 867 aa  288  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 950 aa  285  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 769 aa  285  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.7 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 830 aa  275  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 		 838 aa  273  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 		 739 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.02 
 
 		 734 aa  273  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  30.6 
 
 		 784 aa  271  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 741 aa  271  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.03 
 
 		 776 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 723 aa  268  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.89 
 
 		 722 aa  267  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 		 648 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.27 
 
 		 712 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.83 
 
 		 618 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.45 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 755 aa  261  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 		 806 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 649 aa  260  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 		 648 aa  260  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 819 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.42 
 
 		 735 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.07 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 775 aa  258  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 		 720 aa  257  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.45 
 
 		 720 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 		 654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.49 
 
 		 751 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 871 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 		 710 aa  254  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.28 
 
 		 905 aa  254  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.54 
 
 		 712 aa  254  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 761 aa  252  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 654 aa  251  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 704 aa  250  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 727 aa  250  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 750 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 626 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.39 
 
 		 757 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.09 
 
 		 642 aa  248  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 728 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.35 
 
 		 727 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.2 
 
 		 728 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 833 aa  247  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.85 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 880 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 		 723 aa  246  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  30.73 
 
 		 801 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 776 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 811 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 877 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 		 641 aa  244  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.74 
 
 		 742 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 763 aa  243  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.86 
 
 		 779 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  30.46 
 
 		 638 aa  243  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.5 
 
 		 817 aa  242  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.19 
 
 		 656 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 831 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.69 
 
 		 642 aa  241  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 		 732 aa  240  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  30.6 
 
 		 824 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 788 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>