More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4845 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 978 aa  1962    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  44.56 
 
 		 961 aa  588  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  38.4 
 
 		 719 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  39.76 
 
 		 1306 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  38.8 
 
 		 1117 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.2 
 
 		 1129 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 747 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  38.41 
 
 		 724 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  37.72 
 
 		 822 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 		 1245 aa  332  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 867 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  34.38 
 
 		 836 aa  310  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  35.3 
 
 		 803 aa  304  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 		 695 aa  303  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  35.21 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.32 
 
 		 859 aa  298  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.46 
 
 		 890 aa  298  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 778 aa  290  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 1065 aa  288  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.13 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 		 764 aa  282  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.88 
 
 		 727 aa  279  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 		 814 aa  274  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 		 725 aa  269  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  34.14 
 
 		 808 aa  266  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 950 aa  258  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.29 
 
 		 821 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  29.94 
 
 		 774 aa  250  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  32.36 
 
 		 752 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 806 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 806 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 806 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  32.29 
 
 		 825 aa  243  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 975 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 815 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 979 aa  230  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 648 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.22 
 
 		 735 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 723 aa  219  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  29.98 
 
 		 830 aa  219  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 661 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  30.72 
 
 		 714 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.73 
 
 		 722 aa  214  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  28.85 
 
 		 784 aa  213  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.34 
 
 		 734 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.14 
 
 		 704 aa  211  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 728 aa  211  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.42 
 
 		 833 aa  211  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.86 
 
 		 720 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 769 aa  208  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.84 
 
 		 750 aa  207  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  28.95 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  28.3 
 
 		 734 aa  205  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 739 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 714 aa  204  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  29.46 
 
 		 741 aa  204  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  30.14 
 
 		 761 aa  204  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 755 aa  204  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  30.14 
 
 		 837 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.91 
 
 		 643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.91 
 
 		 643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 		 712 aa  202  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  27.01 
 
 		 927 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  29.02 
 
 		 727 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 837 aa  200  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.05 
 
 		 824 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  29.73 
 
 		 779 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 		 723 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.88 
 
 		 824 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.94 
 
 		 643 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.01 
 
 		 640 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.27 
 
 		 776 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.61 
 
 		 727 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 834 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.17 
 
 		 654 aa  197  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.72 
 
 		 710 aa  197  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  29.39 
 
 		 811 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 846 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  30.3 
 
 		 835 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 834 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.17 
 
 		 625 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.54 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.38 
 
 		 761 aa  196  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 819 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 		 640 aa  195  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 820 aa  195  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 		 710 aa  194  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  29.21 
 
 		 775 aa  194  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  29.25 
 
 		 757 aa  194  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 626 aa  194  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 		 905 aa  193  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 720 aa  193  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  30.35 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 765 aa  193  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 768 aa  193  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 727 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  27.16 
 
 		 987 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 839 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>