More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3097 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  100 
 
 		 961 aa  1942    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  43.53 
 
 		 978 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.23 
 
 		 1129 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  41.92 
 
 		 719 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  39.61 
 
 		 724 aa  423  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  41.59 
 
 		 1117 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.3 
 
 		 747 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  39.38 
 
 		 1306 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  38.36 
 
 		 822 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 		 695 aa  357  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  37.62 
 
 		 764 aa  350  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 867 aa  342  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.35 
 
 		 859 aa  340  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 764 aa  334  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  33.2 
 
 		 836 aa  330  6e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 1245 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 778 aa  326  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.94 
 
 		 890 aa  310  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 725 aa  307  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 1065 aa  299  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  34.67 
 
 		 803 aa  292  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  33.48 
 
 		 808 aa  290  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 		 814 aa  286  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 806 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 806 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 806 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 		 825 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.17 
 
 		 774 aa  273  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.47 
 
 		 727 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  32.48 
 
 		 752 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 		 815 aa  265  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 830 aa  258  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.5 
 
 		 821 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.3 
 
 		 838 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 975 aa  245  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.88 
 
 		 905 aa  245  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  30.51 
 
 		 761 aa  244  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 950 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 979 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.16 
 
 		 618 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 640 aa  227  7e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 769 aa  225  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  30.53 
 
 		 755 aa  223  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 770 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 		 712 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.66 
 
 		 741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 795 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 761 aa  218  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 763 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.37 
 
 		 640 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.1 
 
 		 730 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.95 
 
 		 643 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.95 
 
 		 643 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 833 aa  214  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 		 751 aa  213  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 		 728 aa  212  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.28 
 
 		 654 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.33 
 
 		 723 aa  211  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 824 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.53 
 
 		 643 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.26 
 
 		 714 aa  211  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.53 
 
 		 824 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 714 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  30.07 
 
 		 626 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.84 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 727 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  28.38 
 
 		 739 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  29.07 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.51 
 
 		 625 aa  204  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.1 
 
 		 727 aa  204  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 811 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 828 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  27.65 
 
 		 735 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.78 
 
 		 720 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  30.02 
 
 		 728 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.53 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  30.46 
 
 		 723 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 		 734 aa  202  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.41 
 
 		 727 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.27 
 
 		 806 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  30.2 
 
 		 680 aa  201  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 667 aa  201  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.05 
 
 		 704 aa  201  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.37 
 
 		 779 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.23 
 
 		 658 aa  200  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 861 aa  200  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  29.25 
 
 		 734 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  29.38 
 
 		 833 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.41 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.68 
 
 		 710 aa  199  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 855 aa  198  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  28.61 
 
 		 722 aa  197  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2706  glycosyl transferase family 51  29 
 
 		 728 aa  197  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488127  normal  0.218116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  27.74 
 
 		 750 aa  197  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  29.87 
 
 		 727 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  28.87 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 819 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>