More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0250 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  53.9 
 
 		 801 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  51.6 
 
 		 789 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 892 aa  1757    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  45.26 
 
 		 773 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  43.24 
 
 		 744 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  44.22 
 
 		 739 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.09 
 
 		 737 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  46.53 
 
 		 1057 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.78 
 
 		 736 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.31 
 
 		 759 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 		 820 aa  479  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  40.24 
 
 		 880 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 807 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  38.14 
 
 		 740 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 871 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.48 
 
 		 807 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.79 
 
 		 784 aa  416  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  36.83 
 
 		 821 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.06 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  35.5 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.05 
 
 		 763 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 766 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.62 
 
 		 821 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 766 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  40.52 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 		 723 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  36.1 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 		 877 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.41 
 
 		 817 aa  366  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 		 758 aa  366  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 758 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  33.86 
 
 		 772 aa  351  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  36.08 
 
 		 721 aa  350  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  38.22 
 
 		 814 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 710 aa  337  5.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 710 aa  337  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  38.33 
 
 		 680 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 		 705 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.7 
 
 		 727 aa  320  6e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  33.05 
 
 		 773 aa  319  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  34.97 
 
 		 768 aa  317  9e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 801 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  33.83 
 
 		 838 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 		 703 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 700 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  35.51 
 
 		 771 aa  304  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  34.35 
 
 		 830 aa  303  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 		 840 aa  292  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.84 
 
 		 720 aa  284  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  36.06 
 
 		 722 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.68 
 
 		 810 aa  281  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.27 
 
 		 761 aa  281  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  34.85 
 
 		 750 aa  278  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 817 aa  271  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 818 aa  271  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 1065 aa  267  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 		 824 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.49 
 
 		 710 aa  266  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  33.39 
 
 		 828 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 830 aa  266  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 816 aa  265  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 816 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 816 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 816 aa  263  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 1245 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 831 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 831 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.45 
 
 		 723 aa  261  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 770 aa  260  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  32.49 
 
 		 693 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.08 
 
 		 648 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.16 
 
 		 776 aa  257  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.94 
 
 		 643 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.41 
 
 		 658 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.9 
 
 		 761 aa  252  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 761 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.8 
 
 		 727 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.82 
 
 		 1129 aa  251  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  29.69 
 
 		 750 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  30.16 
 
 		 774 aa  247  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.26 
 
 		 712 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.83 
 
 		 817 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.17 
 
 		 719 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 810 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.62 
 
 		 806 aa  244  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  32.48 
 
 		 692 aa  244  6e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  32.24 
 
 		 764 aa  244  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.4 
 
 		 811 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 742 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.68 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 801 aa  243  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>