More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1277 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  100 
 
 		 774 aa  1601    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  55.38 
 
 		 727 aa  718    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  43.83 
 
 		 836 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.25 
 
 		 764 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40 
 
 		 890 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.23 
 
 		 859 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  39.87 
 
 		 764 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  37.19 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  38.96 
 
 		 803 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  36.64 
 
 		 825 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 		 695 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 778 aa  354  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.23 
 
 		 1129 aa  340  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  37.05 
 
 		 719 aa  336  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  36.48 
 
 		 724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  37.11 
 
 		 1306 aa  326  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 747 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  31.87 
 
 		 822 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 		 1065 aa  286  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 725 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 1245 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  32.6 
 
 		 752 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 961 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  31.52 
 
 		 1117 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 867 aa  272  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.24 
 
 		 776 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.75 
 
 		 814 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.29 
 
 		 714 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.23 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 975 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.98 
 
 		 727 aa  257  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  29.91 
 
 		 978 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  33.9 
 
 		 704 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 727 aa  255  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 		 728 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.54 
 
 		 761 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 806 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 806 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 806 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.5 
 
 		 728 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 979 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.24 
 
 		 821 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.4 
 
 		 714 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.57 
 
 		 739 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 833 aa  243  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  28.93 
 
 		 755 aa  243  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 720 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.03 
 
 		 683 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  30.03 
 
 		 838 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.62 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.46 
 
 		 770 aa  239  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 		 710 aa  236  9e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.59 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 815 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  29.72 
 
 		 779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.31 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.71 
 
 		 735 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.19 
 
 		 817 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 950 aa  234  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.07 
 
 		 618 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  29.8 
 
 		 750 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.93 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 626 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 649 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.36 
 
 		 712 aa  231  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 811 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.36 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.05 
 
 		 683 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.59 
 
 		 734 aa  228  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 769 aa  228  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 721 aa  228  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.51 
 
 		 757 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  31.21 
 
 		 683 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 		 654 aa  227  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.46 
 
 		 905 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 683 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 683 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.51 
 
 		 726 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 		 643 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 		 643 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  31.8 
 
 		 732 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 683 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 683 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.94 
 
 		 806 aa  225  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 683 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  29.53 
 
 		 656 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 667 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 830 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 708 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 730 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 683 aa  224  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 683 aa  224  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.59 
 
 		 727 aa  224  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 763 aa  223  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  30.55 
 
 		 683 aa  223  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.19 
 
 		 679 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>