More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8542 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  65.19 
 
 		 719 aa  795    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  100 
 
 		 724 aa  1456    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  54.14 
 
 		 1306 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.82 
 
 		 1129 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  45.16 
 
 		 1117 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  45.08 
 
 		 822 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.2 
 
 		 747 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 695 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  40.67 
 
 		 961 aa  432  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  43.07 
 
 		 764 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  41.33 
 
 		 867 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.26 
 
 		 859 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.44 
 
 		 764 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 778 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 1245 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  36.3 
 
 		 978 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.56 
 
 		 890 aa  364  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  37.94 
 
 		 836 aa  360  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 		 1065 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  37.64 
 
 		 752 aa  359  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.93 
 
 		 725 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  35.14 
 
 		 808 aa  340  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  36.75 
 
 		 825 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  36.23 
 
 		 774 aa  333  5e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  33.98 
 
 		 727 aa  322  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  37.41 
 
 		 803 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  37.88 
 
 		 821 aa  308  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 		 761 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.05 
 
 		 814 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 806 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 806 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 806 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 815 aa  296  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 		 824 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.11 
 
 		 824 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 830 aa  287  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 975 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 643 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 643 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.01 
 
 		 710 aa  280  5e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.8 
 
 		 643 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 755 aa  277  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 979 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 		 769 aa  274  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 		 950 aa  273  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.85 
 
 		 723 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.91 
 
 		 640 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.09 
 
 		 712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.01 
 
 		 640 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 		 618 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  33.77 
 
 		 677 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.77 
 
 		 648 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 626 aa  261  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 649 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.54 
 
 		 625 aa  260  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.78 
 
 		 784 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 795 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 		 758 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  31.43 
 
 		 838 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.57 
 
 		 801 aa  257  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 		 744 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 		 761 aa  256  8e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.99 
 
 		 751 aa  256  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.01 
 
 		 750 aa  255  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.5 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 		 905 aa  253  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.18 
 
 		 880 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 723 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 654 aa  252  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 		 681 aa  251  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 661 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 820 aa  250  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 		 811 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 828 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 		 720 aa  247  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  30.72 
 
 		 833 aa  247  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 758 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  32.8 
 
 		 662 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  32.28 
 
 		 773 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.01 
 
 		 714 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  34.59 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 770 aa  244  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 683 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 		 699 aa  244  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 819 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.6 
 
 		 734 aa  244  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  32.65 
 
 		 726 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 		 880 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  32.21 
 
 		 683 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 683 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.44 
 
 		 683 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  29.13 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 683 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>