More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0388 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  62.65 
 
 		 1129 aa  839    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 1117 aa  2239    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  48.05 
 
 		 719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  45.16 
 
 		 724 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  45.92 
 
 		 1306 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.23 
 
 		 747 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  40.89 
 
 		 822 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  41.26 
 
 		 961 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  38.79 
 
 		 978 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 695 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 778 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  39.61 
 
 		 764 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 		 867 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  39.39 
 
 		 836 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.41 
 
 		 859 aa  361  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.07 
 
 		 890 aa  350  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 764 aa  345  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  35.98 
 
 		 808 aa  345  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 1245 aa  330  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  34.39 
 
 		 803 aa  314  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.91 
 
 		 814 aa  311  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  37.92 
 
 		 752 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.84 
 
 		 825 aa  306  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  34.4 
 
 		 838 aa  303  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 1065 aa  302  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  32.27 
 
 		 727 aa  298  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 725 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 806 aa  288  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 806 aa  288  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 806 aa  288  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 950 aa  287  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  30.61 
 
 		 774 aa  279  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 		 979 aa  279  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 975 aa  277  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  33.18 
 
 		 821 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  30.91 
 
 		 784 aa  268  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 769 aa  261  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.34 
 
 		 761 aa  259  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  30.63 
 
 		 987 aa  254  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  35.82 
 
 		 677 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 830 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 815 aa  250  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.89 
 
 		 676 aa  247  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  32.16 
 
 		 833 aa  246  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.45 
 
 		 618 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.14 
 
 		 833 aa  241  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 718 aa  240  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.43 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  31.89 
 
 		 807 aa  239  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 		 648 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.28 
 
 		 739 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.32 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 		 705 aa  237  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 		 723 aa  236  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 735 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.32 
 
 		 824 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.58 
 
 		 734 aa  235  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.91 
 
 		 720 aa  235  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  32.59 
 
 		 750 aa  234  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.49 
 
 		 750 aa  234  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  30.71 
 
 		 668 aa  233  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 		 625 aa  231  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  30.55 
 
 		 789 aa  230  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.4 
 
 		 776 aa  230  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 643 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 		 751 aa  230  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.95 
 
 		 712 aa  230  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 643 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.55 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.91 
 
 		 704 aa  230  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 779 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 724 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  32.68 
 
 		 759 aa  229  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 		 776 aa  229  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  30.79 
 
 		 711 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.71 
 
 		 710 aa  228  5.0000000000000005e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 		 712 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 667 aa  228  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  30.11 
 
 		 801 aa  227  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  31.41 
 
 		 680 aa  227  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  32.02 
 
 		 759 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.8 
 
 		 654 aa  227  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  30.28 
 
 		 763 aa  226  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  31.27 
 
 		 680 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.28 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.75 
 
 		 643 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 		 744 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.44 
 
 		 649 aa  226  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.8 
 
 		 642 aa  226  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.62 
 
 		 710 aa  226  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  31.41 
 
 		 680 aa  225  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 673 aa  225  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 673 aa  225  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  32.07 
 
 		 757 aa  225  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 680 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  29.85 
 
 		 755 aa  224  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  32.38 
 
 		 726 aa  224  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  31.41 
 
 		 680 aa  224  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 720 aa  224  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>