More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4341 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
764 aa  1526    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  47.99 
 
 
836 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 
695 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.42 
 
 
764 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.73 
 
 
890 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.91 
 
 
859 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
778 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  41.7 
 
 
803 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  44.17 
 
 
719 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  42.31 
 
 
724 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  40.33 
 
 
808 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  39.74 
 
 
774 aa  432  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.11 
 
 
1129 aa  432  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  43.3 
 
 
1306 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  39.2 
 
 
825 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  39.04 
 
 
822 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  36.57 
 
 
727 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.84 
 
 
747 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
1065 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.48 
 
 
725 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
1245 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  38.9 
 
 
1117 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 
806 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  38.15 
 
 
961 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 
806 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 
806 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  38.45 
 
 
752 aa  354  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 
867 aa  347  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  38.92 
 
 
821 aa  347  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
830 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  33.77 
 
 
978 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
815 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.64 
 
 
814 aa  316  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 
950 aa  314  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 
643 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 
643 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 
618 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  35.48 
 
 
770 aa  300  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.43 
 
 
625 aa  300  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.43 
 
 
776 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.65 
 
 
643 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  37.4 
 
 
710 aa  298  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  36.41 
 
 
710 aa  298  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 
838 aa  297  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.33 
 
 
755 aa  296  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.59 
 
 
734 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.35 
 
 
765 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.74 
 
 
824 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.23 
 
 
714 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.55 
 
 
761 aa  292  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 
723 aa  292  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 
824 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 
730 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 
661 aa  289  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.93 
 
 
648 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 
763 aa  287  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.4 
 
 
649 aa  287  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 
779 aa  287  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.12 
 
 
640 aa  287  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.94 
 
 
761 aa  287  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  33.14 
 
 
833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.64 
 
 
735 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.33 
 
 
720 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.24 
 
 
905 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.37 
 
 
714 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.92 
 
 
732 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
776 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.75 
 
 
739 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.22 
 
 
806 aa  281  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 
734 aa  280  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.79 
 
 
727 aa  280  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.85 
 
 
727 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 
648 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  36.03 
 
 
704 aa  279  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
979 aa  278  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 
811 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  36.7 
 
 
757 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
718 aa  277  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  33.63 
 
 
801 aa  276  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.43 
 
 
784 aa  276  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  34.17 
 
 
626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.86 
 
 
727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  33 
 
 
709 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
820 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
819 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.47 
 
 
640 aa  272  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 
704 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.37 
 
 
720 aa  271  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.87 
 
 
728 aa  271  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 
795 aa  271  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  35.17 
 
 
654 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 
712 aa  270  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.37 
 
 
654 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
975 aa  270  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.66 
 
 
732 aa  270  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  33.86 
 
 
724 aa  269  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.42 
 
 
892 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  31.04 
 
 
665 aa  269  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 
751 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>