More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3356 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
808 aa  1614    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  55.96 
 
 
825 aa  795    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  46.93 
 
 
836 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.91 
 
 
890 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  42.15 
 
 
803 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
764 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.02 
 
 
859 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  40.49 
 
 
764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  37.36 
 
 
727 aa  405  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  37.38 
 
 
774 aa  379  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
695 aa  369  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 
778 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
747 aa  340  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.8 
 
 
1129 aa  337  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  36.54 
 
 
1117 aa  337  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  35.98 
 
 
724 aa  335  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  35.67 
 
 
719 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  36.32 
 
 
1306 aa  326  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
1245 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  34.57 
 
 
822 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  32.93 
 
 
752 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
1065 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  33.43 
 
 
961 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 
725 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 
775 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.98 
 
 
732 aa  289  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.13 
 
 
734 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.95 
 
 
776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.69 
 
 
739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  33.09 
 
 
723 aa  282  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  33.64 
 
 
821 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
867 aa  281  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.81 
 
 
734 aa  280  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
761 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  34.37 
 
 
815 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  33.77 
 
 
978 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.84 
 
 
720 aa  274  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.09 
 
 
712 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.43 
 
 
710 aa  272  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.46 
 
 
643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.46 
 
 
643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.19 
 
 
814 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  32.6 
 
 
784 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 
735 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.47 
 
 
714 aa  268  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.66 
 
 
683 aa  268  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.35 
 
 
770 aa  268  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
710 aa  267  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
714 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 
643 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 
728 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  32.97 
 
 
750 aa  266  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.89 
 
 
683 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 
727 aa  265  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.27 
 
 
755 aa  265  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.18 
 
 
741 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 
727 aa  264  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 
618 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.92 
 
 
833 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.13 
 
 
750 aa  262  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
704 aa  261  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  30.57 
 
 
801 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  35.52 
 
 
757 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  260  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.31 
 
 
683 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 
626 aa  260  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  260  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.14 
 
 
683 aa  260  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.74 
 
 
648 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.2 
 
 
654 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 
681 aa  259  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.63 
 
 
658 aa  258  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
712 aa  258  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.7 
 
 
683 aa  258  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.14 
 
 
683 aa  257  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 
648 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
661 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  257  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
975 aa  257  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
683 aa  257  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 
728 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.21 
 
 
730 aa  256  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 
779 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.07 
 
 
763 aa  256  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
979 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
679 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.07 
 
 
776 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 
712 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  31.8 
 
 
789 aa  254  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.17 
 
 
722 aa  253  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.01 
 
 
642 aa  253  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  33.12 
 
 
732 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
830 aa  253  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.56 
 
 
817 aa  251  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 
796 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>