More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5307 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
789 aa  1610    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  69.19 
 
 
801 aa  1075    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  47.75 
 
 
773 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  51.76 
 
 
892 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.05 
 
 
747 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  43.45 
 
 
744 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  45.55 
 
 
739 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.64 
 
 
737 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 
820 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  45.61 
 
 
1057 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.29 
 
 
736 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.3 
 
 
759 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  43.38 
 
 
880 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
819 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
807 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  39.6 
 
 
784 aa  469  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 
871 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  37.83 
 
 
821 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  37.84 
 
 
740 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  37.38 
 
 
833 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 
877 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.91 
 
 
807 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.54 
 
 
821 aa  416  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  37.82 
 
 
727 aa  416  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.61 
 
 
763 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
758 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
766 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  35.15 
 
 
772 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  36.73 
 
 
721 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
758 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  34.92 
 
 
830 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.4 
 
 
705 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  35.89 
 
 
838 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.19 
 
 
817 aa  379  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 
766 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
723 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  36.46 
 
 
765 aa  379  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  35.35 
 
 
771 aa  376  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
801 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  33.48 
 
 
768 aa  350  9e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
808 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
710 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
840 aa  341  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
710 aa  340  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.39 
 
 
727 aa  339  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.87 
 
 
722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 
816 aa  333  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  32.65 
 
 
773 aa  326  9e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
703 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
700 aa  324  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.09 
 
 
695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  35.36 
 
 
726 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
818 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.38 
 
 
814 aa  317  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
828 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 
817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
816 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 
720 aa  312  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
816 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
816 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.96 
 
 
680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
824 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
831 aa  310  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
831 aa  310  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
830 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  33.8 
 
 
693 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  33.08 
 
 
810 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.68 
 
 
761 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  34.27 
 
 
723 aa  298  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
761 aa  287  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.88 
 
 
643 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 
710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.84 
 
 
643 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.84 
 
 
643 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.23 
 
 
905 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 
776 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 
806 aa  273  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.22 
 
 
710 aa  272  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
695 aa  271  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.86 
 
 
648 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  30.56 
 
 
750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  28.84 
 
 
774 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.88 
 
 
811 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.96 
 
 
618 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.22 
 
 
1129 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  31.46 
 
 
719 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.1 
 
 
626 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.06 
 
 
661 aa  257  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30 
 
 
727 aa  257  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  31.52 
 
 
808 aa  256  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 
755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.85 
 
 
765 aa  255  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.38 
 
 
750 aa  254  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.54 
 
 
683 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
806 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
806 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
806 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
747 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  32.56 
 
 
726 aa  252  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  31.95 
 
 
681 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>