More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4277 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 877 aa  1773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  73.51 
 
 		 871 aa  1163    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 819 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  45.24 
 
 		 880 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.04 
 
 		 747 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  41.62 
 
 		 773 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  41 
 
 		 820 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  39.27 
 
 		 801 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  38.21 
 
 		 789 aa  439  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 		 737 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  39.91 
 
 		 739 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  38.37 
 
 		 744 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.29 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  40.72 
 
 		 1057 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 		 807 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  38.07 
 
 		 740 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  37.99 
 
 		 892 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  36.98 
 
 		 821 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.08 
 
 		 759 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.77 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.09 
 
 		 821 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 758 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  35.74 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  39.05 
 
 		 726 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 		 758 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 766 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  35.19 
 
 		 784 aa  353  8.999999999999999e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.46 
 
 		 763 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  36.67 
 
 		 814 aa  351  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  40.25 
 
 		 680 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  34 
 
 		 830 aa  344  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.07 
 
 		 771 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 840 aa  333  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  35.43 
 
 		 721 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.47 
 
 		 727 aa  330  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 705 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  35.5 
 
 		 807 aa  328  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 808 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.85 
 
 		 838 aa  317  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.86 
 
 		 765 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 		 723 aa  314  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.62 
 
 		 772 aa  314  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 766 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 710 aa  307  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 828 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 		 703 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 831 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 831 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 		 817 aa  301  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 830 aa  301  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.73 
 
 		 720 aa  300  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 		 761 aa  300  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 710 aa  300  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 818 aa  299  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 816 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 700 aa  298  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 		 816 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 		 816 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  35.01 
 
 		 693 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.69 
 
 		 817 aa  286  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  32.71 
 
 		 836 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 816 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.75 
 
 		 722 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.21 
 
 		 773 aa  282  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 		 824 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 695 aa  276  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 		 817 aa  273  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.98 
 
 		 810 aa  269  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.06 
 
 		 643 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.9 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  30.98 
 
 		 768 aa  265  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 761 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 618 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.12 
 
 		 761 aa  254  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 1245 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.2 
 
 		 648 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.1 
 
 		 890 aa  250  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.75 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.7 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 723 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 661 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.02 
 
 		 727 aa  245  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 		 764 aa  244  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.3 
 
 		 806 aa  244  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.39 
 
 		 640 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.71 
 
 		 750 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 795 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 765 aa  243  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.29 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 710 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.39 
 
 		 658 aa  241  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.21 
 
 		 905 aa  240  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  29.85 
 
 		 656 aa  240  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 975 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  30.2 
 
 		 704 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.21 
 
 		 726 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>