More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3240 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  49.7 
 
 
721 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  87.73 
 
 
758 aa  1351    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  60.67 
 
 
703 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
758 aa  1531    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  60.64 
 
 
700 aa  720    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.9 
 
 
766 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.11 
 
 
705 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  48.13 
 
 
808 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  48.11 
 
 
801 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  46.35 
 
 
710 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 
710 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  40.42 
 
 
801 aa  399  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  40.9 
 
 
871 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  39.94 
 
 
880 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  39.7 
 
 
819 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  39.78 
 
 
739 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  38.85 
 
 
773 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  37.63 
 
 
740 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  38.88 
 
 
789 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  39.66 
 
 
744 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
807 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  39.87 
 
 
892 aa  366  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  40.58 
 
 
726 aa  361  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 
1057 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
820 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  38.88 
 
 
821 aa  349  9e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 
737 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  36.89 
 
 
784 aa  343  5e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.87 
 
 
736 aa  343  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 
759 aa  335  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  40.25 
 
 
680 aa  334  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.38 
 
 
695 aa  333  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 
877 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.81 
 
 
763 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 
747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  37.54 
 
 
833 aa  326  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  38 
 
 
814 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  33.15 
 
 
727 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.95 
 
 
727 aa  310  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  35.67 
 
 
830 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.5 
 
 
821 aa  300  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 
818 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 
840 aa  296  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
766 aa  296  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  35.29 
 
 
807 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  35.85 
 
 
765 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.78 
 
 
771 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.54 
 
 
772 aa  287  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  32.4 
 
 
768 aa  287  5.999999999999999e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  36.52 
 
 
810 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
828 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
817 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  32.46 
 
 
773 aa  283  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 
816 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 
816 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 
816 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.05 
 
 
817 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
816 aa  282  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  37.52 
 
 
824 aa  282  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  35.23 
 
 
693 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
723 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.18 
 
 
838 aa  279  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.66 
 
 
750 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  36.35 
 
 
830 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
831 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
831 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  36.14 
 
 
722 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 
761 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.93 
 
 
710 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 
723 aa  261  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.5 
 
 
859 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.05 
 
 
720 aa  252  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  34.77 
 
 
724 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.39 
 
 
661 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.58 
 
 
719 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.93 
 
 
761 aa  245  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.09 
 
 
648 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 
683 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.39 
 
 
658 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.56 
 
 
643 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 
683 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  34.92 
 
 
764 aa  237  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
975 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 
681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 
739 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 
825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.81 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.46 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.81 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
695 aa  235  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 
806 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.05 
 
 
683 aa  234  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
683 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
683 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.41 
 
 
683 aa  233  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
683 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 
808 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.19 
 
 
683 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.35 
 
 
683 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.61 
 
 
811 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>