More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  51.34 
 
 		 693 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  54.97 
 
 		 830 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 720 aa  1488    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  43.65 
 
 		 810 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  43.84 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 		 817 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.58 
 
 		 840 aa  505  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 		 816 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 		 816 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  43.96 
 
 		 816 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 		 816 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 828 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 		 830 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 		 824 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 		 831 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 		 831 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 		 761 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  35.58 
 
 		 726 aa  356  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.26 
 
 		 814 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 695 aa  326  8.000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 		 871 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.24 
 
 		 739 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.67 
 
 		 784 aa  311  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 880 aa  310  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  33.38 
 
 		 773 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.69 
 
 		 763 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 766 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  32.6 
 
 		 744 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 807 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.01 
 
 		 833 aa  298  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  33.29 
 
 		 801 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  32.92 
 
 		 740 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  34.06 
 
 		 892 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.83 
 
 		 821 aa  296  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  33.85 
 
 		 680 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  33.19 
 
 		 789 aa  294  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.14 
 
 		 721 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  33.83 
 
 		 821 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 877 aa  283  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 747 aa  280  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 705 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  31.59 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  30.61 
 
 		 807 aa  265  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 737 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 801 aa  264  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 758 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 766 aa  261  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.1 
 
 		 772 aa  261  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.87 
 
 		 773 aa  257  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.87 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  29.81 
 
 		 727 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 723 aa  254  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  31.04 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 758 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  30.48 
 
 		 765 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 736 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  28.63 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 1057 aa  242  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.84 
 
 		 817 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 759 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  31.69 
 
 		 838 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  29.32 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.71 
 
 		 771 aa  228  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 703 aa  228  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.79 
 
 		 761 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.24 
 
 		 722 aa  227  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  28.2 
 
 		 723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  29.43 
 
 		 768 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 		 648 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  29.91 
 
 		 710 aa  212  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 778 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  26.91 
 
 		 710 aa  203  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  28.23 
 
 		 658 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  27.57 
 
 		 821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  28.77 
 
 		 668 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 661 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 625 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  27.39 
 
 		 822 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 640 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 1245 aa  193  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.01 
 
 		 727 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 1065 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.04 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  28.29 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 975 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  28.55 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  28.17 
 
 		 680 aa  192  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.35 
 
 		 1129 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  29.79 
 
 		 643 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  29.79 
 
 		 643 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  29.73 
 
 		 724 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  28.13 
 
 		 801 aa  190  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>