More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3939 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  54.44 
 
 		 816 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  53.62 
 
 		 810 aa  838    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 830 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 840 aa  1700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  49.43 
 
 		 824 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  55.13 
 
 		 818 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 831 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  54.32 
 
 		 816 aa  860    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.05 
 
 		 816 aa  980    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 831 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  54.32 
 
 		 816 aa  860    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  51.76 
 
 		 828 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  54.83 
 
 		 817 aa  853    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  43.85 
 
 		 830 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  42.03 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.73 
 
 		 720 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.45 
 
 		 761 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  36.76 
 
 		 726 aa  361  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.56 
 
 		 814 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  35 
 
 		 880 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 871 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  32.88 
 
 		 773 aa  327  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 801 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 808 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.57 
 
 		 695 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  33.71 
 
 		 789 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.64 
 
 		 801 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 877 aa  307  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 		 819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 747 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  34.36 
 
 		 680 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  31.96 
 
 		 721 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  32.08 
 
 		 740 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.49 
 
 		 892 aa  295  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 758 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 758 aa  287  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.24 
 
 		 744 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  32.33 
 
 		 821 aa  284  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 820 aa  282  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 766 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 705 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  32.55 
 
 		 739 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 		 737 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 807 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 1057 aa  272  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  30.39 
 
 		 784 aa  268  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.75 
 
 		 821 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  30.19 
 
 		 833 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.89 
 
 		 763 aa  251  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 759 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 736 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 700 aa  238  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 710 aa  237  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  30.23 
 
 		 727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 703 aa  227  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  29.5 
 
 		 771 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.3 
 
 		 723 aa  223  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  27.81 
 
 		 807 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  29.73 
 
 		 761 aa  221  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 1245 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.15 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 766 aa  218  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  30.26 
 
 		 722 aa  217  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.89 
 
 		 817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  27.89 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  29.63 
 
 		 772 aa  211  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  28 
 
 		 838 aa  211  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  30.55 
 
 		 710 aa  206  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 723 aa  204  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  29.07 
 
 		 768 aa  203  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  28.8 
 
 		 750 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.81 
 
 		 732 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.43 
 
 		 734 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.71 
 
 		 712 aa  200  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  28.72 
 
 		 643 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  29.71 
 
 		 757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 		 761 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29.44 
 
 		 648 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.14 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  29.25 
 
 		 773 aa  196  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.47 
 
 		 625 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.88 
 
 		 734 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 1065 aa  195  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.08 
 
 		 726 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  29.84 
 
 		 710 aa  193  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.12 
 
 		 735 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.71 
 
 		 618 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28.37 
 
 		 648 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  28.55 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.38 
 
 		 680 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  28.77 
 
 		 626 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  28.45 
 
 		 763 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  28.19 
 
 		 658 aa  190  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  27.98 
 
 		 905 aa  190  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  27.79 
 
 		 646 aa  188  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.37 
 
 		 720 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  28.53 
 
 		 836 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.82 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>