More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3526 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  75.83 
 
 
727 aa  1159    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  62.81 
 
 
772 aa  933    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  62.41 
 
 
766 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
723 aa  1491    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  39.3 
 
 
833 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.71 
 
 
784 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.83 
 
 
727 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  41.8 
 
 
821 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.85 
 
 
807 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.07 
 
 
821 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  38.37 
 
 
765 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.7 
 
 
763 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  37.99 
 
 
773 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  39.3 
 
 
838 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  35.96 
 
 
801 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  35.67 
 
 
892 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 
820 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  35.46 
 
 
789 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.5 
 
 
740 aa  357  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
807 aa  353  7e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 
1057 aa  350  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
819 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.99 
 
 
739 aa  346  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 
880 aa  345  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 
737 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.95 
 
 
744 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.31 
 
 
817 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  33.94 
 
 
773 aa  326  7e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
747 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 
736 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.87 
 
 
768 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
871 aa  301  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
877 aa  300  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  33.79 
 
 
721 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.38 
 
 
771 aa  296  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  33.98 
 
 
726 aa  294  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
758 aa  286  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 
758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.43 
 
 
761 aa  281  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 
722 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 
814 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
705 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  31.81 
 
 
801 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
766 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.65 
 
 
723 aa  266  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
808 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 
751 aa  260  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
710 aa  259  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.58 
 
 
720 aa  257  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
710 aa  257  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 
710 aa  252  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  34.75 
 
 
750 aa  250  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
695 aa  249  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 
710 aa  248  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  31.5 
 
 
680 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 
648 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  29.06 
 
 
693 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  27.67 
 
 
774 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.55 
 
 
618 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.43 
 
 
640 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.25 
 
 
806 aa  240  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  29.13 
 
 
830 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.1 
 
 
661 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.04 
 
 
643 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 
727 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.71 
 
 
890 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  28.14 
 
 
750 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 
640 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  26.99 
 
 
648 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  33.39 
 
 
703 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  28.43 
 
 
755 aa  228  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  31.08 
 
 
825 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.18 
 
 
708 aa  227  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
700 aa  227  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  28.34 
 
 
649 aa  226  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  29.75 
 
 
707 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  29.77 
 
 
752 aa  225  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.49 
 
 
765 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.26 
 
 
761 aa  224  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  29.87 
 
 
762 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
764 aa  223  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.88 
 
 
811 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.25 
 
 
625 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 
760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.25 
 
 
980 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.28 
 
 
776 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 
725 aa  220  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.13 
 
 
829 aa  220  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 
840 aa  219  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 
730 aa  219  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  30.1 
 
 
714 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  29.38 
 
 
824 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  28.72 
 
 
654 aa  216  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  29.23 
 
 
824 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.36 
 
 
683 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  29.94 
 
 
801 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 
705 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
867 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>