More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3548 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 710 aa  1463    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  52.57 
 
 		 721 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  95.63 
 
 		 710 aa  1372    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.3 
 
 		 766 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 		 758 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 		 758 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.89 
 
 		 705 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  45.19 
 
 		 808 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 		 801 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  47.94 
 
 		 700 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  47.28 
 
 		 703 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  34.85 
 
 		 739 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  35.24 
 
 		 784 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  35.5 
 
 		 892 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  34.26 
 
 		 773 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 880 aa  347  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  37.31 
 
 		 801 aa  346  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.46 
 
 		 744 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 807 aa  344  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 819 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 737 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 820 aa  333  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  36.17 
 
 		 789 aa  333  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.58 
 
 		 740 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 1057 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 871 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.25 
 
 		 727 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 		 736 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.96 
 
 		 747 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  31.81 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.34 
 
 		 763 aa  297  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  32.28 
 
 		 807 aa  295  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  32.7 
 
 		 821 aa  294  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  32.15 
 
 		 814 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 877 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  33.23 
 
 		 765 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  32.71 
 
 		 680 aa  280  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.84 
 
 		 830 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  32.71 
 
 		 833 aa  275  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 816 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 766 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  32.95 
 
 		 838 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.85 
 
 		 821 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 723 aa  266  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  30.96 
 
 		 772 aa  266  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.91 
 
 		 720 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.33 
 
 		 727 aa  262  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.08 
 
 		 750 aa  253  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 840 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.34 
 
 		 643 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  31.22 
 
 		 693 aa  251  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  29.14 
 
 		 768 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.06 
 
 		 817 aa  247  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.12 
 
 		 648 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.59 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.36 
 
 		 810 aa  242  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  28.57 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  28.57 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.01 
 
 		 806 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.61 
 
 		 712 aa  237  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.28 
 
 		 773 aa  236  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.84 
 
 		 722 aa  235  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.55 
 
 		 761 aa  235  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 824 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.1 
 
 		 661 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.82 
 
 		 723 aa  233  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.6 
 
 		 905 aa  232  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.02 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 828 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 818 aa  231  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.71 
 
 		 640 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.81 
 
 		 859 aa  230  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  29.62 
 
 		 761 aa  230  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.07 
 
 		 710 aa  230  8e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 816 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 816 aa  228  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 816 aa  228  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.23 
 
 		 727 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  30.01 
 
 		 975 aa  225  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 979 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.08 
 
 		 776 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 817 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 640 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  28.25 
 
 		 811 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.61 
 
 		 681 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  28.89 
 
 		 683 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  28.94 
 
 		 680 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.61 
 
 		 941 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 683 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 828 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  31.03 
 
 		 764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  27.86 
 
 		 683 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  27.86 
 
 		 683 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 683 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  28.49 
 
 		 683 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>