More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5121 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  53.19 
 
 		 830 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  51.28 
 
 		 720 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 693 aa  1418    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 		 818 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.03 
 
 		 840 aa  522  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.29 
 
 		 816 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  43.23 
 
 		 810 aa  505  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  45.15 
 
 		 816 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  45.15 
 
 		 816 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  44.49 
 
 		 828 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  44.27 
 
 		 817 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  45.01 
 
 		 816 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 		 824 aa  499  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 		 830 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 		 831 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 		 831 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.43 
 
 		 761 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.94 
 
 		 695 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  38.56 
 
 		 726 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  39.06 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.35 
 
 		 744 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  35.21 
 
 		 814 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 766 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  33.15 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 		 820 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.37 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 880 aa  293  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  32.72 
 
 		 784 aa  293  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 737 aa  293  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.53 
 
 		 740 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.6 
 
 		 801 aa  292  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  33.47 
 
 		 833 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 871 aa  287  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 808 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 801 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 819 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  32.4 
 
 		 739 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 		 789 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  33.01 
 
 		 821 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 807 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 758 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  31.83 
 
 		 807 aa  273  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 736 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 877 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.73 
 
 		 721 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.64 
 
 		 892 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  31.78 
 
 		 727 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 705 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  31.03 
 
 		 765 aa  257  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  31.85 
 
 		 771 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 		 759 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 1057 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.66 
 
 		 773 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  30.76 
 
 		 768 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.29 
 
 		 817 aa  239  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.78 
 
 		 763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.05 
 
 		 727 aa  236  9e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 766 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  28.59 
 
 		 723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.65 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  30.15 
 
 		 772 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  32.07 
 
 		 838 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  29.05 
 
 		 750 aa  223  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.5 
 
 		 648 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 703 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  30.7 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.06 
 
 		 722 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  29.78 
 
 		 710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.39 
 
 		 723 aa  214  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 643 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 643 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  28.84 
 
 		 712 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  29.25 
 
 		 618 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.02 
 
 		 693 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  29.61 
 
 		 836 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.31 
 
 		 640 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  27.12 
 
 		 643 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.47 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  28.91 
 
 		 905 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 695 aa  194  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  28.12 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  27.41 
 
 		 658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.49 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 646 aa  191  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.57 
 
 		 704 aa  190  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.56 
 
 		 734 aa  190  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  28.69 
 
 		 719 aa  190  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  28.86 
 
 		 727 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  28.06 
 
 		 890 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.19 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.03 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  27.06 
 
 		 751 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>