More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3015 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 758 aa  1531    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  87.73 
 
 		 758 aa  1338    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  61.51 
 
 		 700 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  49.7 
 
 		 721 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  60.73 
 
 		 703 aa  726    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.49 
 
 		 766 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.1 
 
 		 705 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  47.92 
 
 		 808 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  48.19 
 
 		 801 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 		 710 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  46.14 
 
 		 710 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  41.99 
 
 		 801 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  39.81 
 
 		 789 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 819 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  38.36 
 
 		 744 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 		 871 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  38.56 
 
 		 892 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 		 880 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  39.07 
 
 		 773 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  36.93 
 
 		 739 aa  365  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 		 740 aa  361  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  39.88 
 
 		 726 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 807 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.79 
 
 		 737 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 820 aa  349  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.19 
 
 		 736 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  37.54 
 
 		 784 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 1057 aa  343  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  38.22 
 
 		 821 aa  339  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 		 695 aa  334  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  39.84 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.48 
 
 		 877 aa  326  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  38.59 
 
 		 814 aa  320  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 759 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.03 
 
 		 763 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.82 
 
 		 833 aa  313  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  36.38 
 
 		 830 aa  310  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.59 
 
 		 727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 747 aa  308  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.26 
 
 		 821 aa  297  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 		 771 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 840 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 816 aa  289  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.42 
 
 		 727 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 766 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 817 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 761 aa  288  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 818 aa  287  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  34.45 
 
 		 807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.65 
 
 		 772 aa  283  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.17 
 
 		 817 aa  280  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  32.05 
 
 		 768 aa  280  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  32.56 
 
 		 773 aa  280  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.1 
 
 		 810 aa  279  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.59 
 
 		 838 aa  276  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.45 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  36.17 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 723 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 		 828 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  35.48 
 
 		 722 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 824 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 		 830 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.72 
 
 		 750 aa  266  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 		 831 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 		 831 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.6 
 
 		 859 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.96 
 
 		 720 aa  254  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  34.51 
 
 		 724 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.64 
 
 		 723 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.52 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 683 aa  243  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 683 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.95 
 
 		 681 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.65 
 
 		 658 aa  240  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.42 
 
 		 683 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 		 648 aa  240  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.42 
 
 		 683 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.32 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  32.77 
 
 		 825 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  34.42 
 
 		 764 aa  238  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 695 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.25 
 
 		 683 aa  237  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 683 aa  237  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 683 aa  237  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.01 
 
 		 683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 683 aa  235  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.33 
 
 		 806 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 755 aa  232  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  31.18 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 975 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  32.73 
 
 		 719 aa  230  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 		 714 aa  230  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  33.69 
 
 		 808 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>