More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3399 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  77.26 
 
 		 772 aa  1142    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  59.95 
 
 		 727 aa  899    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 766 aa  1568    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  62.62 
 
 		 723 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  40.47 
 
 		 833 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.87 
 
 		 784 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  39.16 
 
 		 807 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  39.49 
 
 		 838 aa  432  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.81 
 
 		 763 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  38.5 
 
 		 765 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  38.75 
 
 		 821 aa  422  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.34 
 
 		 727 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  36.83 
 
 		 773 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.36 
 
 		 821 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  35.56 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  34.42 
 
 		 892 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 820 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.99 
 
 		 789 aa  379  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.95 
 
 		 740 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 		 807 aa  357  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 819 aa  340  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 1057 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.47 
 
 		 739 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.24 
 
 		 817 aa  333  8e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.88 
 
 		 771 aa  331  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.89 
 
 		 744 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 880 aa  327  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  33.19 
 
 		 773 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 737 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.64 
 
 		 768 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 736 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.79 
 
 		 721 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  33.94 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 		 759 aa  297  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 871 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 758 aa  290  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 758 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.38 
 
 		 761 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 877 aa  283  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 766 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.79 
 
 		 722 aa  277  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  33.94 
 
 		 814 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.86 
 
 		 723 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 710 aa  271  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.61 
 
 		 751 aa  269  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.2 
 
 		 710 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 		 705 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 801 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.4 
 
 		 750 aa  258  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 808 aa  257  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  33.12 
 
 		 680 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.72 
 
 		 720 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 710 aa  255  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 710 aa  255  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.51 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 695 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 725 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.64 
 
 		 806 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 661 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 		 757 aa  240  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  28.18 
 
 		 648 aa  238  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.83 
 
 		 811 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  30.51 
 
 		 693 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  29.76 
 
 		 618 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.74 
 
 		 776 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.31 
 
 		 817 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.45 
 
 		 830 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 		 727 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 708 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  28.84 
 
 		 643 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.74 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 765 aa  226  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 774 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.62 
 
 		 739 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.74 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  31 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 818 aa  225  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 667 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.33 
 
 		 658 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.49 
 
 		 683 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 700 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.51 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.32 
 
 		 680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  27.45 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  29.16 
 
 		 980 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 703 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  28.51 
 
 		 808 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.63 
 
 		 625 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.86 
 
 		 734 aa  221  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.66 
 
 		 732 aa  221  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.14 
 
 		 720 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 829 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.43 
 
 		 734 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 816 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 764 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 816 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 816 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 683 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 840 aa  218  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>